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DIA/4D-DIA蛋白定量分析
可对蛋白质组进行鉴定、定量,获得肽段、蛋白及所属物种来源、蛋白表达量变化等信息。
服务类别:分子与细胞总访问:251
最后更新:2022-10-17半年访问:27
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  • 服务介绍
  • 公司简介
DIA/4D-DIA蛋白定量分析,主要采用数据非依赖性采集模式(data independent acquisition,DIA),通过液质联用技术(LC-MS/MS)对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,结合传统的数据依赖性采集模式(data dependent acquisition,DDA)构建的谱图库,可对蛋白质组进行鉴定、定量,获得肽段、蛋白及所属物种来源、蛋白表达量变化等信息。
4D-DIA在传统保留时间、质荷比和离子强度的基础上,增加了离子淌度,在检测过程中能够进一步降低待测样本的复杂程度,更有利于对样本进行高深度检测。4D-DIA为实现定量蛋白组分析的高覆盖度、高准确性和大样本的深度分析带来了更优秀的解决方案。

 产品优势

  • 国内唯一参与DIA测评及建立大队列DIA标准的企业,华大具有高水平的DIA技术交付能力,从鉴定数、重现性、线性、动态范围等方面看,已达到全球先进水平;具有极佳的软硬件优势和过硬的操作流程;
  • 血清/血浆鉴定数突破1,500+,覆盖更多低丰度、低分子量蛋白;
  • 重复性、稳定性高达90%,是大队列血液样品蛋白质组研究首选技术;
  • 自建血液样品谱图库BGI-BPSL(Blood Proteome Spectral Library),实际项目无需再次建库;
  • 针对富含临床信息的FFPE样品,提供低至1片的蛋白质组定量服务;
  • 采用Dr. Tom云平台进行数据交付,便于开展零生信基础的数据挖掘,以及同转录组的自主关联分析;
  • 提供经典的蛋白质组非靶向发现+靶向验证一站式服务;以及蛋白质组+转录组、蛋白质组+代谢组、常规蛋白质组+磷酸化蛋白质组学等一系列多组学关联分析服务。

产品应用

  • 精准医疗领域

       癌症研究:肿瘤组织个体差异大背景差异大,需要单个样本采样比较

       个体医疗:大规模的数据采集,需要高稳定性和重现性的技术支撑

  • 动植物微生物研究领域

       环境适应性研究:多种环境不同水平的处理同时比较,需要高稳定性和重现性的技术支撑

       模式生物机理研究:深入探究体内调控机理,实现不同组别差异蛋白比较

 

技术路线

dia1

 

 信息分析内容

信息分析条款

信息分析内容

标准信息分析

标准信息分析内容

1.1 数据产出统计

1.2 数据质控(组内变异系数、主成分分析以及样本定量相关性)

1.3 蛋白质鉴定和定量结果

1.4 蛋白质GO分析

1.5 蛋白质COG/KOG/eggNOG分析

1.6 蛋白质Pathway代谢通路分析

1.7 差异蛋白的GO富集分析

1.8 差异蛋白COG/KOG/eggNOG富集分析

1.9 差异蛋白的Pathway富集分析

1.10 重复性分析(仅针对设计了重复的实验)

1.11多样品间表达模式聚类(三个或三个以上样品可提供)

1.12 时间序列分析

1.13 差异表达蛋白互作分析

1.14 差异表达蛋白亚细胞定位

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