DIA/4D-DIA蛋白定量分析,主要采用数据非依赖性采集模式(data independent acquisition,DIA),通过液质联用技术(LC-MS/MS)对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,结合传统的数据依赖性采集模式(data dependent acquisition,DDA)构建的谱图库,可对蛋白质组进行鉴定、定量,获得肽段、蛋白及所属物种来源、蛋白表达量变化等信息。
4D-DIA在传统保留时间、质荷比和离子强度的基础上,增加了离子淌度,在检测过程中能够进一步降低待测样本的复杂程度,更有利于对样本进行高深度检测。4D-DIA为实现定量蛋白组分析的高覆盖度、高准确性和大样本的深度分析带来了更优秀的解决方案。
产品优势
- 国内唯一参与DIA测评及建立大队列DIA标准的企业,华大具有高水平的DIA技术交付能力,从鉴定数、重现性、线性、动态范围等方面看,已达到全球先进水平;具有极佳的软硬件优势和过硬的操作流程;
- 血清/血浆鉴定数突破1,500+,覆盖更多低丰度、低分子量蛋白;
- 重复性、稳定性高达90%,是大队列血液样品蛋白质组研究首选技术;
- 自建血液样品谱图库BGI-BPSL(Blood Proteome Spectral Library),实际项目无需再次建库;
- 针对富含临床信息的FFPE样品,提供低至1片的蛋白质组定量服务;
- 采用Dr. Tom云平台进行数据交付,便于开展零生信基础的数据挖掘,以及同转录组的自主关联分析;
- 提供经典的蛋白质组非靶向发现+靶向验证一站式服务;以及蛋白质组+转录组、蛋白质组+代谢组、常规蛋白质组+磷酸化蛋白质组学等一系列多组学关联分析服务。
产品应用
癌症研究:肿瘤组织个体差异大背景差异大,需要单个样本采样比较
个体医疗:大规模的数据采集,需要高稳定性和重现性的技术支撑
环境适应性研究:多种环境不同水平的处理同时比较,需要高稳定性和重现性的技术支撑
模式生物机理研究:深入探究体内调控机理,实现不同组别差异蛋白比较
技术路线
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信息分析内容
信息分析条款
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信息分析内容
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标准信息分析
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1 标准信息分析内容
1.1 数据产出统计
1.2 数据质控(组内变异系数、主成分分析以及样本定量相关性)
1.3 蛋白质鉴定和定量结果
1.4 蛋白质GO分析
1.5 蛋白质COG/KOG/eggNOG分析
1.6 蛋白质Pathway代谢通路分析
1.7 差异蛋白的GO富集分析
1.8 差异蛋白COG/KOG/eggNOG富集分析
1.9 差异蛋白的Pathway富集分析
1.10 重复性分析(仅针对设计了重复的实验)
1.11多样品间表达模式聚类(三个或三个以上样品可提供)
1.12 时间序列分析
1.13 差异表达蛋白互作分析
1.14 差异表达蛋白亚细胞定位
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华大科技于2012年完成整合,致力于成为全球生命科学研究机构的首选科技服务商,为从事生命科学研究的机构和企业提供高质量、行业领先的基因测序、质谱、合成生物学、生物数据库、云计算等标准化的技术服务和综合的全流程解决方案。 目前,公司服务已经覆盖了全球100多个国家和地区,拥有7,000多位合作单位,为25,000多位行业联系人提供了杰出技术支撑与服务,更通过深度合作完成了一系列大型基因组科研计划和国际多边合作项目。科研积累上,截至2020年9月底,公司累计参与发表近1,500篇文章,其中CNNS 120+。截止2022年3月,华大自主测序平台DNBSEQTM 助力发表2,013+篇高质量文章,影响因子合计8,800+,并实现CNS三大主刊发文。