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蛋白测序，得到一级结构序列，公司有数据库可提供数据检索
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| 服务商： 无锡纳奥生物医药有限公司 | 查看该公司所有服务 >> |
蛋白质组学服务
1 服务内容
多肽、蛋白质的电喷雾质谱分子量测定以及天然产物、生物大分子、有机分子的质谱测试和数据分析。按样品类型分具体如下：
胶内酶解样品：
样品类型：SDS-PAGE胶条，2-DE 点胶块
肽段制备：脱色 还原 烷基化 酶解 肽段提取和C18柱脱盐纯化
蛋白鉴定：nanoflow LC-MS/MS；300 µm ID C18RPC trap columns, 75µm ID×15cm C18 pepmep 100A. 流动相：A 0.1%甲酸 B 84% 乙腈 0.1%甲酸；LTQ或Orbitrap。
数据检索：SEQUEST软件，特殊物种请提供蛋白数据库。
样品类型：SDS-PAGE胶条，2-DE 点胶块
肽段制备：脱色 还原 烷基化 酶解 肽段提取和C18柱脱盐纯化
蛋白鉴定：nanoflow LC-MS/MS；300 µm ID C18RPC trap columns, 75µm ID×15cm C18 pepmep 100A. 流动相：A 0.1%甲酸 B 84% 乙腈 0.1%甲酸；LTQ或Orbitrap。
数据检索：SEQUEST软件，特殊物种请提供蛋白数据库。
酶解后蛋白样品：
样品类型：酶解后溶液肽段或冻干肽段
蛋白鉴定：nanoflow LC-MS/MS；300 µm ID C18RPC trap columns, 75µm ID×15cm C18 pepmep 100A. 流动相：A 0.1%甲酸 B 84% 乙腈 0.1%甲酸；LTQ或Qrbitrap。
数据检索：SEQUEST软件，特殊物种请提供蛋白数据库。
样品类型：酶解后溶液肽段或冻干肽段
蛋白鉴定：nanoflow LC-MS/MS；300 µm ID C18RPC trap columns, 75µm ID×15cm C18 pepmep 100A. 流动相：A 0.1%甲酸 B 84% 乙腈 0.1%甲酸；LTQ或Qrbitrap。
数据检索：SEQUEST软件，特殊物种请提供蛋白数据库。
总蛋白酶解：
样品类型：蛋白溶液或蛋白冻干粉
肽段制备：溶液内全蛋白酶解，还原 烷基化 酶解 肽段提取和C18柱脱盐纯化
蛋白鉴定：nanoflow LC-MS/MS；300 µm ID C18RPC trap columns, 75µm ID×15cm C18 pepmep 100A. 流动相：A 0.1%甲酸；B 84%乙腈 0.1%甲酸；LTQ或Qrbitrap。
数据检索：SEQUEST软件，特殊物种请提供蛋白数据库。
样品类型：蛋白溶液或蛋白冻干粉
肽段制备：溶液内全蛋白酶解，还原 烷基化 酶解 肽段提取和C18柱脱盐纯化
蛋白鉴定：nanoflow LC-MS/MS；300 µm ID C18RPC trap columns, 75µm ID×15cm C18 pepmep 100A. 流动相：A 0.1%甲酸；B 84%乙腈 0.1%甲酸；LTQ或Qrbitrap。
数据检索：SEQUEST软件，特殊物种请提供蛋白数据库。
2 设备描述
LTQ™ Orbitrap™是由多级线性离子阱（LTQ）和静电场轨道阱（Orbitrap）串联组合高分辨质谱仪，是20年来离子阱质谱技术的重大突破，为小分子研究、药物开发、蛋白质组学、代谢物鉴定和代谢体学提供了更出众的性能。LTQ Orbitrap对在复杂混合物的成分检测和鉴定中提供了更快速、灵敏和可靠的分析能力。在质量准确度、质量分辨率和常规、高灵敏MSn能力方面有出色的表现。
主要性能指标：
Max. Resolution： >100,000
Std Operating Resolution:60,000 @ m/z 400
Internal Standard - MS:< 2 ppm RMS with iLock
Internal Standard - MS/MS:< 2 ppm RMS with iLock
External Standard - MS < 5 ppm (typically 1-3ppm)
External Standard - MS/MS< 5 ppm (typically 1-3ppm)
Mass range:50 to 4000 Da;
split into low and high range,50 to 2000 and 200 to 4000Da
Sensitivity: Sub femtomole.
Max. Resolution： >100,000
Std Operating Resolution:60,000 @ m/z 400
Internal Standard - MS:< 2 ppm RMS with iLock
Internal Standard - MS/MS:< 2 ppm RMS with iLock
External Standard - MS < 5 ppm (typically 1-3ppm)
External Standard - MS/MS< 5 ppm (typically 1-3ppm)
Mass range:50 to 4000 Da;
split into low and high range,50 to 2000 and 200 to 4000Da
Sensitivity: Sub femtomole.
为了实现高通量的蛋白质组鉴定，为LTQ-Orbitrap质谱仪配备了多维色谱仪（EttanTM MDLC），从而实现了蛋白质多肽混合物从分离到鉴定的完美结合。
3 样品提交
送检样品要求:
- 至少提供5-10pmol样本量；如果是干粉，提供10ug，如果是溶液，请提供ug/ul的浓度，体积约30ul。若提供蛋白电泳胶条，请提供相应蛋白染色图像照片；送样时请在样本提交表格中注明样品的品名、来源、溶剂、浓度、目标分子量、联系方式，以及样品是否需要返还等。
- 样品尽量不含无机酸碱、盐、离子表面活性剂、去垢剂及难挥发性盐。如果在样本提取过程中使用高盐、去污剂等化学试剂，请使Pierce PepClean C-18 Spin Columns (Cat. 89873)纯化多肽。
- 酶解过程中所使用DTT可于-20℃冰冻保藏半年；碘乙酰胺(IAA)现用现配,不可重复使用；溶液配制要用Milli-Q级别的水配制；操作过程中要用进口无蛋白枪头和离心管；操作过程勿带乳胶手套，可用PE手套；多肽样品制备好后，可于4℃短期保存3-7天，-20℃保存一个月
- 未知种属请提供相应蛋白质数据库，不提供全新蛋白测序(De novo sequencing)服务。
- 每周五、周六为对外服务时间，可跑样本约26个。每个样本机时两个小时，数据库检索按每个样本复杂程度由30分钟至8小时不等。收到样本的第二周周五出鉴定结果报告。如果质谱仪忙碌，报告时间顺延。
- 可按要求提供DVD数据刻录，本公司不负责保留数据。
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