激光共聚焦显微成像和3D图像分析技术服务平台

功能应用实验
· 细胞生物学
细胞结构、细胞骨架如微丝、微管的分布、细胞膜结构、流动性、受体、细胞器结构和分布变化、细胞凋亡等。
· 生物化学
酶、核酸、 FISH 、受体分析等。
· 药理学
药物对细胞的作用导致细胞功能和形态的改变等。
· 遗传学和组胚学
细胞增殖分化marker表达定位、细胞的三维结构、染色体分析等。
· 神经生物学
神经细胞结构、神经递质的成分、运输和传递等。
· 微生物学和寄生虫学
细菌、寄生虫形态结构等。
· 病理学及病理学临床应用
活检标本的快速诊断、自身免疫性疾病的诊断、病理组织切片免疫组化实验的观察等。
· 发育生物学
观测受精卵及早期胚胎发育、肢体形成、模式生物如（果蝇、线虫、斑马鱼）的完整生物体成像、类器官发育分化、血管及血流变化等。

功能应用领域
高分辨共聚焦成像系统可以应用于自主创新药物研发的很多领域：
· 新药研究领域
抗体药研究领域：Car-T治疗、小分子药物等在细胞及亚细胞信号肿瘤信号通路、膜蛋白入核、蛋白相互作用、细胞膜流动性、Ca²⁺变化等相关研究。
核酸药物研究领域：高分辨激光共聚焦成像系统是研究纳米递送材料在细胞和组织内有效发挥作用的必备工具。
神经及眼科疾病相关药物的研究领域：神经类疾病需要很多高分辨全玻片扫描的脑片或者脊髓实验结果，眼科疾病需要很多全眼或者整个视网膜的全玻片高分辨的实验分析需求。

· 类器官研究领域
       高分辨激光共聚焦显微镜可以有效地3D重构类器官的三维结构，可以有效的结合类器官的特点和激光共聚焦高分辨成像的特点研究药物在类器官水平的有效性和毒理，其也可以用肿瘤类器官研究CAR-T药物或其他药物的耐药性。
· 基因治疗领域
     基因治疗需要在组织水平研究AAV的有效性，其迫切需要能够做全玻片扫描且分辨率高的激光共聚焦分析AAV在组织水平的有效性。

激光共聚焦显微镜拍摄--样品准备
1. 最好采用共聚焦专用培养皿或载玻片制备样品（普通细胞培养皿底部较厚，不能高倍镜拍摄），载玻片上的样品最好 滴加防淬灭剂并封片处理；
2. 细胞铺设数量最好不要密集或稀疏，合适的密度有助于采集清晰可靠的荧光信号；
3. 为了方便采集高质量的荧光信号图像：请选择合适的抗体和染剂，抗体和染剂应确保在效期内，抗体免疫原性相对 应，染色后应充分润洗并保存在湿润的避光盒中；
4. 染色后在2小时内尽快进行拍摄；
5. 拍摄前确定抗体或染剂的激发光波段；
6. 样品运输过程中全程避光。

激光共聚焦显微镜拍摄--常见问题
Q1. 为什么拍摄背景较高？
可能由于润洗不充分或样品污染，应确保操作中不要引入外源污染，染色后充分润洗。
Q2. 为什么拍摄图片的荧光暗淡？
可能是染剂或抗体的质量问题，样本不能被特异性标记或染色效果较差；也可能因为样品存放问题如时间过长， 产生荧光淬灭。
Q3. 为什么免疫荧光信号杂乱，看不到单独的细胞？
可能由于细胞铺设过密，导致细胞堆叠，荧光信号重叠。
Q4. 为什么组织染色，拍摄效果较淡或较深？
可能染剂的浓度和染色时间不合适，可调整相应的浓度和时间。

案例分析（一）
细胞荧光实验--亚细胞形态结构分析


细胞荧光实验--亚细胞形态结构分析



显微图像分析--IMARIS软件（9.8版）

案例分析（一）
2D去卷积/降噪


案例分析（二）
降噪/统计


案例分析（三）
算法模拟形态分析



MARIS软件渲染动画应用（9.8版）

案例分析（一）
Multicolor multiscale brain imaging with chromatic multiphoton serial microscopy


案例分析（二）
Imaging plant germline differentiation within Arabidopsis flowers by light sheet microscopy


案例分析（三）
Phenome-based approach identifies RIC1-linked Mendelian syndrome through zebrafish models, biobank associations and clinical studies

 

       上海生物芯片有限公司成立于2001年8月，公司由上海科技创业投资（集团）有限公司、上海张江（集团）有限公司、中科院上海有关院所、上海交通大学等在上海的国内知名大学、研究所、医院和企业共同组建而成，经国家发展与改革委员会批准公司建设和运行“生物芯片上海国家工程研究中心”，是我国生物医药领域规模最大的生物技术国家工程研究中心之一，是全国生物样本标准化技术委员会（TC559）、中国医药生物技术协会组织生物样本库分会（BBCMBA）与中国抗癌协会肿瘤样本整合研究分会的秘书处与主任委员单位。

       通过二十余年的建设和发展，公司（中心）确立了以生物样本库、基因芯片、高通量测序、蛋白芯片、组织芯片、数字化病理、分子病理与生物信息学为核心平台的技术创新服务体系，以分子医学检测技术和分子诊断产品研发生产为核心竞争力的产业化体系，形成科研和药物研发技术服务、分子诊断产品研发生产销售和分子医学检验三大主营业务，公司（中心）具备科研及公共技术平台服务优势、成熟的科技成果转化服务能力、国家工程研究中心品牌影响力等强大的自身资源及优势。