核小体是由DNA和组蛋白形成的染色质基本结构单位。核小体再折叠最终形成高度压缩的染色质结构。在复制和转录时高度折叠的染色质结构打开并暴露出DNA序列,这段DNA序列可被转录因子和其他调控原件结合,即染色质开放性。同时,这段裸露的DNA区域也是ATAC-SEQ需要研究的部分。
ATAC-SEQ测序技术介绍
ATAC-SEQ,全称Assay for Transpo sase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing,即利用Tn5转座酶结合到开放染色质上并酶切捕获暴露的DNA序列,然后使用高通量测序技术对捕获到的DNA序列进行建库测序。

ATAC-SEQ测序原理
实验流程

技术参数
推荐测序方式:illumina 测序平台,PE150,建议至少10G/每个样本
样本要求:新鲜细胞,数量1x103—1x105个;新鲜组织,质量为50mg/份
建议对有参考基因组的物种进行ATAC-SEQ
bio-equip.com
上海生物芯片有限公司成立于2001年8月,公司由上海科技创业投资(集团)有限公司、上海张江(集团)有限公司、中科院上海有关院所、上海交通大学等在上海的国内知名大学、研究所、医院和企业共同组建而成,经国家发展与改革委员会批准公司建设和运行“生物芯片上海国家工程研究中心”,是我国生物医药领域规模最大的生物技术国家工程研究中心之一,是全国生物样本标准化技术委员会(TC559)、中国医药生物技术协会组织生物样本库分会(BBCMBA)与中国抗癌协会肿瘤样本整合研究分会的秘书处与主任委员单位。
通过二十余年的建设和发展,公司(中心)确立了以生物样本库、基因芯片、高通量测序、蛋白芯片、组织芯片、数字化病理、分子病理与生物信息学为核心平台的技术创新服务体系,以分子医学检测技术和分子诊断产品研发生产为核心竞争力的产业化体系,形成科研和药物研发技术服务、分子诊断产品研发生产销售和分子医学检验三大主营业务,公司(中心)具备科研及公共技术平台服务优势、成熟的科技成果转化服务能力、国家工程研究中心品牌影响力等强大的自身资源及优势。