外泌体蛋白质组学服务

上海逍鹏生物提供外泌体蛋白质组学服务，无需昂贵的同位素标记试剂，实验周期短；可用于不同物种间的“有无差异蛋白”比较；克服标记定量技术在样本数量的上限制，灵活方便。

服务类别：	分子与细胞	总访问：	303
最后更新：	2024-6-4	半年访问：	6
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服务商：上海逍鹏生物科技有限公司

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服务介绍
公司简介

TMT标记定量蛋白组学

TMT (Tandem mass tag)是由ThermoFisher Scientific公司研发的一种多肽体外等重同位素标记的相对与绝对定量技术，采用6、10及16种同位素的标签，通过特异性标记多肽的氨基基团，经高分辨质谱仪串联分析，可同时比较多达16种样品之间的蛋白质表达量，是定量蛋白质组学中经典的高通量筛选技术。

实验流程

数据分析

标准数据分析内容
蛋白质总鉴定数量分析	蛋定与定量结果统计、差异结果统计、火山图、聚类热图
差异蛋白质功能分析	亚细胞定位、结构域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作网络分析
质量控制分析	肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布

技术优势

同一批次标记的样本统一处理，减少样本处理及实验误差，实验平行性较高
同一批次标记定量稳定性高
通过分级方法可深度可大大增加蛋白鉴定深度

DIA蛋白质组学

DIA（data-independent acquisition，数据非依赖性采集）技术是近年来发展起来的一种新的质谱技术，属于非标记蛋白质组学方法。采用数据非依赖性扫描模式：将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口，然后对每个窗口中的所有离子进行检测、碎裂，从而无遗漏、无差异地获得样本中所有离子的信息。从而降低样本检测的缺失值，同时提高定量准确性和重复性，实现大样本队列中高稳定，高精准的蛋白质组定量分析。
与DDA技术相比，DIA技术的优势包括：
（1）采集所有的离子信息，实现更高的数据覆盖度；
（2）减少采集的随机性，实现极高的检测重现性、稳定性；
（3）采用碎片离子定量，定量精密度、准确性、线性范围大大提高。基于上述技术优势，DIA技术尤其适用于大规模样本的高度覆盖、稳定和可追溯地分析。

实验流程

数据分析

标准数据分析内容
鉴定结果统计与分析	样本蛋白质及肽段鉴定柱状图、PCA分布图、定量差异统计分析
生物信息学分析	GO及GO富集、KEGG及KEGG富集分析、PPI互作网络与module分析
生物信息学分析	差异上下调蛋白KEGG蝴蝶图、KEGG通路功能归属等

技术优势

全扫描模式：数据非依赖性采集模式，大大减少高丰度干扰，全面采集高低丰度信号，数据覆盖度提高近40%
超高重现性、稳定性：大样本鉴定重复率提升近40%，定量精密度提升近1倍
超高定量准确度：定量能力接近金标准SRM/MRM靶向技术

Label free 蛋白质组

Label free是一种不依赖于同位素标记的非标记蛋白组定量技术，通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用昂贵的稳定同位素标签做内标，只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，比较不同样品中相应肽段的信号强度，从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。

实验流程

数据分析

标准数据分析内容
蛋白质总鉴定数量分析	蛋定与定量结果统计、差异结果统计、火山图、聚类热图
差异蛋白质功能分析	亚细胞定位、结构域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作网络分析
质量控制分析	肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布

技术优势

无需昂贵的同位素标记试剂，实验周期短
可用于不同物种间的“有无差异蛋白”比较
克服标记定量技术在样本数量的上限制，灵活方便

TMT、Label Free、DIA如何选择

下单方式：

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保密承诺

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