技术介绍:
PulseDIA技术是西湖欧米的专利技术,在传统的DIA 技术的基础上,将一个窗口根据质荷比分割成更小范围的多个窗口,并将这些窗口以脉冲的方式均匀分配至不同的质谱方法进行采集。同一个样本分成多次短梯度进样,每次进样方法均有不同的质谱窗口,最后合并分析几次采集的质谱数据,达到更高的多肽和蛋白质鉴定量。
技术优势:
1. 西湖欧米专利技术,在常规DIA的基础上提升蛋白鉴定数量10%-30%;
2. 结合PCT样本前处理技术,可以实现临床微量样本(如FFPE、穿刺活检、泪液等)的高深度蛋白质定量分析,组织样本最低送样量只需0.1mg。
项目案例:
Mol Cell Proteomics | 深度DIA蛋白质组学鉴定慢性髓系白血病获得性耐药的靶向调节因子
为了解K562细胞对甲磺酸伊马替尼(IMA)和阿霉素(ADR)耐药的潜在机制,用低剂量IMA或ADR处理K562细胞2个月,根据耐药指数的增加判断其对药物的轻、中、重度耐药。基于PulseDIA定量蛋白质组学技术从数据集中总共鉴定和量化了98232种肽的7082种蛋白质。发现Sirtuin信号通路在耐ADR和耐IMA的K562细胞中显著富集。特别是,IDH2被确定为与耐药表型相关的潜在药物靶标。
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西湖欧米(杭州)生物科技有限公司创立于2020年7月,是一家专注于AI赋能的微观世界数据公司。欧米致力于以蛋白质组大数据技术创新为驱动力,联合多模态大数据,助力精准医学和药物研发。西湖欧米凝聚了百余位具有生物、医疗、AI等不同学科背景的高素质人才队伍。