定量蛋白质组学(Quantitative Proteomics)是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行精确鉴定和定量。可用于筛选和寻找任何因素引起的样本之间的差异表达蛋白,结合生物信息学揭示细胞生理病理功能,同时也可对某些关键蛋白进行定性和定量分析。
iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)技术是由AB SCIEX公司研发的一种体外同重同位素标记的相对与绝对定量技术。蛋白定量iTRAQ技术利用多种同位素试剂标记蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基团,经高精度质谱仪串联分析,可同时比较多达8种样品之间的蛋白组表达量差异,是近年来定量蛋白质组学常用的高通量筛选技术。
IBT(Isobaric Tags)蛋白定量分析,作为常规iTRAQ蛋白定量分析的升级版,是华大基因首推的蛋白定量领域新产品。它基于华大基因与合作伙伴共同开发的IBT标记技术,通过深入优化实验步骤和信息分析流程,将原本iTRAQ技术的标记上限8个样本/批次,增加至16个样本/批次甚至更多,结合高分辨率质谱仪高效快速的扫描效率,全面解决多于8个比较组的蛋白样本定量问题。IBT蛋白定量分析产品能够提供优于常规iTRAQ技术的鉴定、定量结果,为广大客户提供一种性价比更高的蛋白组定量分析新选择。
TMT(Tandem Mass Tag)串联质谱标记技术是由Thermo公司研发的一种体外同重同位素标记的相对与绝对定量技术。蛋白定量TMT技术利用多种同位素试剂标记蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基团,包括4plex、8plex、16plex等不同数量标签的产品,经高精度质谱仪串联分析,最新推出的TMTpro 18plex可同时比较多达18个样品之间的蛋白组表达量差异,是近年来定量蛋白质组学常用的高通量筛选技术。

图1 TMT试剂结构
产品优势
- 通量高:可同时对2-18种以内实验样本进行蛋白组定量分析和比较;
- 周期短:标记混合上样大幅度压缩机时,缩短项目周期;
- 重复性高:采用多个标记样本同时上机的方法,避免样本分别上机检测和传统制胶实验重复性差的问题;
- 经验丰富:10余年丰富项目经验,40+项质控保障,200+篇质谱文章发表;
- 云平台交付:采用Dr. Tom云平台进行数据交付,便于开展零生信基础的数据挖掘,以及同转录组的自主关联分析;
- 一站式、多组学服务:提供经典的蛋白质组非靶向发现+靶向验证一站式服务;以及蛋白质组+转录组、蛋白质组+代谢组、常规蛋白质组+磷酸化蛋白质组学等一系列多组学关联分析服务。
产品应用
疾病生物标志物筛选和验证
疾病发生发展过程中的蛋白表达调控机制
药效评估
重要农作物农艺性及其改良措施
动植物生长发育机制研究
抗逆抗病机制研究
致病机理研究
耐药性研究
宿主-微生物的相互作用机制研究
技术路线
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信息分析
信息分析条款
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信息分析条款
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标准信息分析
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1 标准信息分析内容
1.1 数据产出统计
1.2 蛋白质鉴定结果
1.3 蛋白质定量结果
1.4 蛋白质GO分析
1.5 蛋白质KOG/COG/eggNOG分析
1.6 蛋白质Pathway代谢通路分析
1.7 差异蛋白的GO富集分析
1.8 差异蛋白的Pathway富集分析
1.9 差异蛋白KOG/COG/eggNOG富集分析
1.10 重复性分析(仅针对设计了重复的实验)
1.11多样品间表达模式聚类(三个或三个以上样品可提供)
1.12 差异表达蛋白互作分析
1.13 差异表达蛋白亚细胞定位
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华大科技于2012年完成整合,致力于成为全球生命科学研究机构的首选科技服务商,为从事生命科学研究的机构和企业提供高质量、行业领先的基因测序、质谱、合成生物学、生物数据库、云计算等标准化的技术服务和综合的全流程解决方案。 目前,公司服务已经覆盖了全球100多个国家和地区,拥有7,000多位合作单位,为25,000多位行业联系人提供了杰出技术支撑与服务,更通过深度合作完成了一系列大型基因组科研计划和国际多边合作项目。科研积累上,截至2020年9月底,公司累计参与发表近1,500篇文章,其中CNNS 120+。截止2022年3月,华大自主测序平台DNBSEQTM 助力发表2,013+篇高质量文章,影响因子合计8,800+,并实现CNS三大主刊发文。