次生代谢产物(Secondary metabolites)是不直接涉及到生命正常生长、发育或繁殖的有机化合物,次生代谢产物在植物中起着重要的作用,与抵御病虫害及应对环境胁迫密切相关。次生代谢产物主要包含:生物碱、黄酮类、萜类、糖苷类等。部分次级代谢产物可以作为药物、调味品或药物。本方法利用基于高分辨质谱的LC-MS非靶向代谢组技术,建立了庞大的初级代谢物和次生代谢物的数据库,通过“MS1+MS2+RT”或“MS1+MS2”的方式辅助人工谱图解析对代谢物进行鉴定,助力植物代谢组学研究。
实验流程
送样建议
样本类型 |
常规送样量 |
最低送样量 |
建议生物学重复 |
植物组织 |
≥400 mg |
≥200 mg |
重复数≥6 |
水培分泌物 |
≥10 mL(可自行提前冷冻浓缩) |
≥5 mL(可自行提前冷冻浓缩) |
其他样本 |
请另外咨询 |
备注:根系分泌物等类似样本因为代谢物浓度低,客户可自行取等量体积冻干之后寄送给我们,以便得到更好的实验结果
应用方向
生物领域各个研究方面,如:
▶ 植物次生代谢物活性成分鉴定
▶ 植物抗病虫害、抗逆研究
数据分析
分析类型 |
分析内容 |
质控 |
TIC、QC等多项 |
差异分析 |
单变量统计分析(火山图等) |
多维统计分析(PCA、PLSDA、OPLSDA)等 |
功能分析 |
层次聚类分析 |
相关性分析 |
KEGG分析 |
高级生信分析 |
回归分析 |
趋势聚类分析 |
技术优势
▶ 实测定性数目多:均定性数目在800+
▶ 物质种类多:包含生物碱、黄酮类、萜类、糖苷类等众多次级代谢物和初级代谢产物
▶ 鉴定准确:QE高分辨质谱,严格谱图匹配标准(MS1,MS2,RT,人工谱图解析)
▶ 严格质控:多项严格QC系统,保证定性定量结果最优
参考文献
1.Identification and Mode of Inheritance of Quantitative Trait Loci for Secondary Metabolite Abundance in Tomato. Plant Cell. 2015.
植物次生代谢组-番茄-番茄次生代谢产物和性状位点的鉴定及遗传模式研究
2.Primary transcript of miR858 encodes regulatory peptide and controls flavonoid biosynthesis and development in Arabidopsis. Nature Plants. 2020.
植物次生代谢组-拟南芥- miR858的初级转录物编码调控肽控制拟南芥类黄酮的合成
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