随着质谱技术的灵敏度和分辨率的提高,样本分离分级方法进一步优化,PTM的测序深度不断增加。单就磷酸化而言,深度测序技术在人类、拟南芥等生物中已可坚定到6万多个修饰位点。而在其他PTM上的表达谱研究也不断刷新着研究者们的已有认知。这无不向我们展示出PTM表达谱巨大的研究潜力。
实验流程
应用方向
生物领域各个研究方面,如:
▶ 磷酸化:信号转导、细胞周期、生长发育及癌症机理等;
▶ 糖基化:蛋白质折叠、更新以及免疫应答等;
▶ 乙酰化:基因表达调控、细胞凋亡、细胞代谢、蛋白质稳定性以及神经退行性病变等;
▶ 泛素化:细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA修复以及信号转导等;
▶ 甲基化:染色质结构及转录调控等;
▶ 丙酰化 / 丙二酰化 / 戊二酰化 / 琥珀酰化:主要存在于线粒体和细菌中,与代谢过程密切相关。
数据分析
表 |
图 |
蛋白质鉴定列表 |
修饰位点统计绘图 |
修饰位点鉴定列表 |
GO功能富集图 |
肽段保守motif分析列表 |
KEGG通路图 |
GO功能列表 |
保守motif分析 |
KEGG信号通路Mapping表 |
蛋白质互作网络分析 |
技术优势
▶ 采用CST金标抗体富集,特异性高,结果可靠
▶ 鉴定通量高,可检测高达2.5万+个磷酸化修饰位点
参考文献
1.Mass-spectrometry-based draft of the Arabidopsis proteome. 2020.Nature. (IF 49.962)
磷酸化修饰蛋白谱+蛋白组+转录组绘制拟南芥蛋白质组草图
2.Proteome-wide identification and functional analysis of ubiquitinated proteins in peach leaves.2020.Scientific Reports. (IF 4.379) 【客户文献】
泛素化蛋白谱揭示泛素化在作物不同生理阶段中的作用
3.N-glycosylation proteomic characterization and cross-species comparison of milk fat globule membrane proteins from mammals. 2016. Proteomics. (IF 3.984) 【客户文献】
构建哺乳动物乳汁脂肪球膜蛋白N-糖基化表达谱bio-equip.com
中科新生命(APTBIO)自2004年成立以来,已建立科技服务(蛋白/修饰/代谢研究)、生物医药表征确证及精准医疗三大服务平台。APTBIO前身为原中国科学院上海生命科学研究院蛋白质组研究分析中心对外服务部,是最早参与国际HLPP(肝脏)、HPPP(血浆)项目的平台之一,已获得CMA计量认证,邓白氏认证及ISO9001质量认证。作为国内提供质谱系统解决方案的领航者,中科新生命已在高水平SCI杂志上发表论文数百篇;获得各项发明专利和专业著作权数十项;并建立具有自主知识产权的实验室信息管理系统(LIMS),强化了实验室质量监测和质量管理,保证客户数据的高效安全性。APTBIO秉承“为人类健康事业做出贡献”的信念,整合蛋白质组、代谢组、临床诊疗及医药研发数据,为实现基础研究到临床的完美转化提供精准平台。