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4D-DIA定量蛋白质组学
基于timsTOF Pro质谱仪,通过捕集离子淌度(TIMS)与同步累积连续碎裂(PASEF)扫描模式进行差异定量蛋白质组学研究。
服务类别:分子与细胞总访问:148
最后更新:2023-4-23半年访问:7
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  • 服务介绍
  • 公司简介
4D-蛋白质组学是基于timsTOF Pro质谱仪,通过捕集离子淌度(TIMS)与同步累积连续碎裂(PASEF)扫描模式进行差异定量蛋白质组学研究。该技术核心是在传统3D分离(保留时间、质荷比、离子强度)基础上,增加肽段的碰撞截面积(CCS),实现第4维度(离子淌度)的分离检测。 4D-DIA蛋白质组学是基于timsTOF Pro离子淌度平台的DIA技术,通过数据非依赖采集-同步累积连续碎裂(diaPASEF)扫描模式进行差异定量蛋白质组学分析。将DIA技术与基于timsTOF Pro上的diaPASEF技术相结合,具有高扫描速度和高灵敏度优势的同时,外加第四维离子淌度分离,使DIA数据在采集时不牺牲窗口循环速度的同时,降低谱图复杂度和提高离子利用率,实现了蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。

实验流程
 
 
应用方向
▶ 药物应答、基因敲除/过表达的蛋白表达谱分析
▶ 植物、微生物生长发育与胁迫逆境生理研究
▶ 疾病生物标志物与药物作用靶点高通量分析
▶ 蛋白作用机制与特殊功能蛋白质筛选
▶ 各种物种的蛋白质组草图构建

数据分析
 
 
技术优势
▶ 4D技术加持,更加适合微量样本
▶ 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制,灵活方便
▶ 采用布鲁克的timsTOF Pro质谱平台,检测速度提升近一倍
 
推荐组合产品
大分子专属平台,质量与效率双重保障:4D-DIA + 4D-DIA磷酸化蛋白质组
 
参考文献
1.Immune suppression in the early stage of COVID-19 disease. Nat Commun. 2020.
4D-DIA-人尿液-新冠病毒早期感染机制
2.diaPASEF: parallel accumulation–serial fragmentation combined with data-independent acquisition. Nat Methods. 2020.
4D-DIA技术原理介绍:diaPASEF
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