swath定量|swath定量蛋白质组

   SWATH（Sequential Window Acquisition of all THeoretical Mass Spectra）是瑞士苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold 博士及其团队与AB-SCIEX联合推出的一项全新的质谱技术。SWATH采集模式是一种新型的MS/MS 扫描技术，它将扫描范围划分为以25 Dalton 为间隔的一系列区间，通过超高速扫描来获得扫描范围内全部离子的所有碎片信息，是 MS/MSALL技术的扩展。SWATH技术是一种真正全景式的、高通量的质谱技术，同时也大大提高了定量的可重现性。

  金开瑞现有的Triple-TOF 5600-plus质谱系统，使SWATH定量具有较高的准确度和动态范围，可检测到蛋白质的丰度差异极大，跨越4个数量级。且SWATH方法的灵敏度和动态范围与SRM分析水平相当。

  经过多年的研发，金开瑞已成功开发SWATH定量与分析技术，现为国内首家推出SWATH技术服务的公司！

 

一、服务特色

技术特点

1、灵敏度高：SWATH技术继承了MRM的数据采集模式，结合高分辨率的AB sciex Triple TOF-plus，具有与MRM相当的灵敏度；

2、可重现性高：重复样品间的定量相关性可达到0.99以上；

3、定量准确度高：定量准确度几乎与MRM技术相当；

4、线性动态范围广：定量范围可跨越4个数量级；

5、通量大：一次实验可检测到2000种以上蛋白并定量。

 

适用范围

物种具有基因组序列、ESTs序列或蛋白质参考序列

检测细菌等复杂度较低的样品

可以和MRMHR技术联合使用发现生物标志物

可以和TAP技术联合使用鉴定相互作用蛋白

 

二、服务说明

服务流程

接受订单及样品——蛋白提取——蛋白质定量——还原烷基化、酶切——除盐、抽干——HPLC分离——LC-MS/MS DDA模式质谱检测——LC-SWATH模式质谱检测——生物信息分析——结果交付

客户提供

需鉴定的样品；

样品信息单，需详细填写样品来源、含量、状态及其他基本信息。

最终交付

实验报告一份，含具体实验流程及蛋白质组鉴定及定量结果（生物信息学分析）。

生物信息学分析内容包括：

SWATH 参考谱图数据库构建：通过DDA模式的扫描结果，谱图数据库构建、全谱鉴定及结果可靠性评估

SWATH定量：根据二级碎片离子的全扫描结果实现二级离子的定量；SWATH结果可靠性分析；差异表达分析；层次聚类；PCA分析等。

蛋白质功能注释：包括GO注释、COG分类和KEGG Pathway分析

差异蛋白功能富集：包括GO富集、Pathway富集

差异蛋白网络互作：基于STRING 数据库的PPI分析，基于Cytoscape的可视化展示

 

三、服务周期及报价

服务周期

自送样起45个工作日。

服务报价

请询价。

 

如您对swath定量感兴趣或者需要技术支持，请您与我联系QQ：3013422302，或者浏览我们公司的网站http://www.genecreate.cn/，可以搜索到您想要的服务信息，武汉金开瑞生物有限公司期待和您的合作。

武汉金开瑞生物工程有限公司位于武汉国家生物产业基地，是一家专业致力于为全球制药企业、诊断试剂企业、科研试剂研发企业、高校和科研院所以及大型医院提供蛋白及相关研究技术服务的高新技术企业。
关注蛋白整体研究思路，围绕蛋白的读、解、写、用，金开瑞建立起蛋白组、检测分析、基因服务、病毒包装、蛋白表达、抗体制备六大核心技术平台。所有平台的实验室及技术团队都坚持自主建设，各平台技术负责人都有5年以上相关领域的工作经验，可以最大程度的保障了项目按时保质的实施。完整的技术平台及专业的技术团队，保证了金开瑞不仅可以提供单一项目的技术服务，还可以提供miRNA，lncRNA，蛋白质组学相关等多种整合性项目服务。
“读”——对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的序列解读，定量、定位检测；
“解”——采用基因手段（干预、敲除或过表达）对预测的蛋白信息进行确证和深入分析；
“写”——通过体外重组方法制备，并通过系列实验确认其结构与功能尽可能的接近天然状态；
“用”——与客户合作讲蛋白的检测和合成领域的成果开发到市场需求标准的产品或平台。
六大技术平台：
蛋白质组分析平台——iTRAQ、SWATH、SILAC、Label-free，各种蛋白质组定量技术协助您发现信号转导通路关键蛋白、发现疾病标记物、发现药物靶标。
检测分析平台——通过免疫学分析方法（WB、IHC、IF、IP、ChIP、ELISA等），获得蛋白定量、定位等各种信息，确定您的目标蛋白。
基因服务平台——立足中心法则，围绕DNA/RNA/蛋白质开展全方位基因研究服务，合成&测序、载体构建、定点突变、qRT-PCR、RACE、CRISPR/Cas9……助您全面奠定蛋白研究基础。
病毒包装平台——13000种人源克隆库，各种功能载体，提供慢病毒、腺病毒、腺相关病毒包装及慢病毒稳转细胞株筛选服务，是您进行基因功能研究的绝佳助手。
蛋白表达平台——提供从基因合成到蛋白表达的一站式服务，史上最全的六大表达系统，噬菌体展示技术，帮助您获得任意想要的蛋白。
抗体定制平台——单/多克隆抗体、人源化抗体、基因工程抗体、双特异性抗体、修饰抗体、诊断抗体、小分子抗体、抗体对……真正保证型应用型抗体定制，只有您想不到，没有我们做不到。

金开瑞坚持“以客户为中心”，专注于蛋白及相关研究，致力于做您最贴心的蛋白研究合作伙伴。