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Fiasco-STR引物开发技术服务(Fiasco)
磁珠富集法从未知基因组中开发SSR引物。
服务类别:分子与细胞总访问:780
最后更新:2017-9-24半年访问:7
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  • 服务介绍
  • 公司简介

    SSR标记是一种基于DNA长度多态性的分子标记技术。它具有共显性、高度可重复性、是研究群体遗传学、进行分子标记辅助育种、系谱分析和法医鉴定的理想工具。只因为SSR标记具有种族特异性,必须采用特异引物进行PCR检测,故而存在一个引物开发的问题。磁珠富集法开发未知基因组序列物种的引物,通过PAGE验证,可以清晰的分析出多态引物,用于后边的批量试验。

   1)SSR-开发技术路线

    前期确认阶段:试验样本类型,数量,签订试验合作合同;

    试验阶段:(30个工作日)包括选取4-6个样本进行多态性验证;

    试验结果:通过磁珠富集微卫星序列,

   2) 试验案例:我们已经开发过多个树种,昆虫,花卉,藻类植物,大型真菌等。例如松树、槭树、桑树、毛竹、兰花、萤火虫、月季、食用真菌、鱼,虾等。

   3)SSR开发服务内容

    1 样本基因组DNA的提取;

    2 构建文库并对特异性序列进行测序;

    3 4-10个样本的PAGE(JY-CX2B型 测序电泳槽)验证图;

    4 开发出30—40对具有一定重复特征的微卫星引物,并且对引物进行多态性和特异性验证;

    5 提供保证8条以多态性引物

   4)客户提供:

    A. 基因组DNA:至少50μL样品,浓度为50-100ng/μL;

    B.2%琼脂糖电泳检测有DNA主带,没有降解;

    C.DNA经过DNA纯化试剂盒或磁珠纯化;

    D. DNA需溶解在TE里;

    E. DNA溶解后,肉眼看不到杂色;

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