BPRC拥有AB SCIEX TripleTOF™ 5600、Q Exactive plus质谱仪、Thermo Scientific LTQ Orbitrap Velos、TSQ Quantum XLS和QTRAP 5500 LC/MS/MS等质谱仪,具备蛋白质制备、分离、纯化及质谱鉴定和定量等实验条件。拥有丰富的定量蛋白质组学技术服务经验。
服务项目
Ø iTRAQ蛋白质定量
Ø SILAC蛋白质定量
Ø 无标记蛋白质定量(Label-free)
Ø SRM/MRM蛋白质定量
Ø 绝对定量(AQUA)
Ø 蛋白质组学半定量
Ø SILAC-AQUA蛋白质组学定量及目标验证
Ø 基于SILAC技术的定量(qConCAT)
Ø 转录因子(包括核受体)、泛素化蛋白精确定量
Ø 差异荧光凝胶电泳分析(DIGE)
SILAC蛋白质定量
SILAC(Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture)的基本原理是分别用天然同位素(轻型)或稳定同位素(重型)标记的必需氨基酸取代细胞培养基中相应氨基酸,细胞经5-6个倍增周期后,稳定同位素标记的氨基酸完全掺入到细胞新合成的蛋白质中替代了原有氨基酸。不同标记细胞的裂解蛋白按细胞数或蛋白量等比例混合,经分离、纯化后进行质谱鉴定。
研究人员通过在细胞培养时加入稳定的同位素标记的氨基酸,用这种方法进行双重的蛋白质序列分析,从而可以跟踪蛋白质的转归或者对不同培养条件下蛋白质的表达情况进行比较。
转录因子(包括核受体)、泛素化蛋白精确定量
目前实验室已经在单一细胞中发现超过300个泛素化位点,200个转录因子,其中包含超过37个核受体。
基于SILAC技术的定量(qConCAT)
采用人工合成、SILAC培养基诱导、表达、标记肽段作为内参的方法,可准确定量差异超过10%以上的蛋白。
联系方式
北京蛋白质组研究中心
蛋白质组学国家重点实验室
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21世纪是生命科学的世纪。随着人类基因组计划的完成,人类蛋白质组研究成为生命科学乃至自然科学领域重大的科学命题。为了引领生命科学发展潮流,推动我国蛋白质组研究的发展,整合国内优势资源,提高国际竞争实力,2004年6月30日,由军事医学科学院、中国科学院、中国医学科学院、清华大学、北京大学、江中集团及北京生物技术和新医药产业促进中心共同创建北京蛋白质组研究中心。2005年10月29日,中心入驻中关村生命科学园。
北京蛋白质组研究中心致力于具有自主知识产权的蛋白质组和功能基因组的研究与开发,目标是建设国际一流的集蛋白质组科学研究与开发、技术创新、人才培养、成果转化、信息交流与技术服务于一体的国家级研究中心和基地。
中心目前已建立蛋白质表达谱、修饰谱、相互作用、定位、抗体工程、生物信息学、功能蛋白质组、功能基因组、蛋白质组新技术和蛋白质工程等尖端高通量技术平台。