代谢组学技术服务UPLC------Q-TOF LC/MS

                    代谢组学服务UPLC­­­---Q-TOF LC/MS 
 
声明： 为保护客户的权益与保密协议，在保证实验结果真实有效的前提下，我们对实验的数据进行了适当的变动处理，简化了实验流程及采样数量。请勿转载！责任自负！
 
使用仪器：液-质联用
UPLC­-----Agilent 1290
Q-TOF LC/MS------Thermo Orbitrap Elite(分辨率> 240,000 FWHM)或Thermo  QE
 
样品信息：
患病组血清样品vs.对照组血清样品
 
实验流程：
通过UPLC­­­----Q-TOF LC/MS分析，分析患病组和对照组血清样品代谢成分，获得代谢组分的实验数据。利用数学分析方法寻找患病组和对照组中具有差异性的代谢组分，建立未知样本分析模型。
 
实验步骤：
 

一、采样
对样本来源进行分组，并记录性别、年龄、病情、治疗等信息；
采集全血，离心后获得血浆/清样本，于-80℃冰箱中保存。

血浆/清样本用提取液（甲醇-乙腈）沉淀蛋白，并于-20℃下提取化合物1 h；高速离心后取上清液，经真空抽干后复溶于甲醇溶液。


二、仪器分析及数据预处理（信息峰的提取和识别）


图一  人血清样品典型的LC／MS总离子流图(TIC, ESI+，m/z 60–1000.)



三、数据分析

 
图二：主成分（ PCA ）得分图： 每个点代表一个样本，对照组和患病组样本在 CA 空间 可以明显的分为两组


  
图三：   偏最小二乘法判别分析 （ 3D PLS-DA ， S-Plot ），寻找 候选生物标志物，可用 于 疾病诊断和模型识别



四、差异代谢物鉴定

图四： 高分辨率 MS/MS 鉴定，右图是左图（一级质谱结果）单峰的二级质谱结果

 


另：生物信息学服务内容：后期数据分析及挖掘
 
 A 、疾病识别，诊断模型
 
 B 、系统生物学分析

图五： 疾病潜在生物标志物的代谢通路分析，阐释发病机制和生命现象



 

    西农生（北京）生物技术有限公司是开展蛋白质组技术专业服务的生物技术公司,搭建了以Amersham的高通量双向电泳系统和Bruker公司最先进的autoflex II TOF/TOF质谱系统为基础的，配以样品处理及蛋白质数据分析为辅的蛋白质技术平台，提供从样品处理到2D胶,直到质谱鉴定及数据分析的全流程服务。

   公司拥有样品前处理实验室及二维电泳实验室,质谱（bruker autoflex II TOF/TOF）实验室等,工作由具有蛋白组技术经验的技术人员完成，主要员工均具有硕士以上学历，多年从事蛋白技术实践经验.公司已与全国多家医院，高校及科研院所开展了及正在开展蛋白质组课题的合作。
客户名单如下：
医院：北医三院，解放军309医院，北京朝阳医院，四川大学华西医院，昆明延安医院等。
高校：中国农业大学，北京农学院，北京林业大学，河南农业大学，内蒙古农业大学，青海大学，重庆医科大学，新疆医科大学等。
科研院所：中科院遗传与发育所，中科院海洋所，中科院农业资源中心，中国林业科学研究院，医科院药植所，医科院病原所，中国CDC营养所，山东省农科院等。

详情请登陆http://www.scilongs.com 有案例

开展蛋白质组,蛋白纯化及测序，代谢组，生物信息技术等服务,详情请登陆http://www.scilongs.com