宏蛋白质组学(Metaproteomics)是使用基于质谱(MS)的蛋白质组学来研究特定时刻下微生物群落的所有蛋白。这些群落可以是环境样品的一部分(例如土壤,淤泥,废水,海洋等)。
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宏蛋白质组学(Metaproteomics)是使用基于质谱(MS)的蛋白质组学来研究特定时刻下微生物群落的所有蛋白。这些群落可以是环境样品的一部分(例如土壤,淤泥,废水,海洋等),也可以存在于宿主生物体内(例如人的肠道,黏膜腔等)。
宏蛋白质组分析的关键点之一的数据库主要有两种途径获得:
1)在公共数据库中提取相应物种序列数据库用于分析
2)通过宏基因组等手段深度测序样品中的物种序列作为参考序列
实验流程
技术特点
应用方向