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DNA甲基化芯片
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概念和原理
DNA甲基化是表观遗传学的重要调控方式，在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起到重要作用。
基因组DNA起声打断后，用重亚硫酸盐处理，全基因组扩增和酶切片断化后，与芯片上的等位基因特异性引物退火、杂交，用高解析度芯片扫描仪检测杂交信号。
科研和临床应用
l 全基因组范围内检测甲基化位点：
l 研究启动子甲基化对基因的调控；
l 比较不同细胞、组织、肿瘤的甲基化图谱：
l 寻找疾病诊断和预后的分子靶点。
标本采集、保存、运输
l 基因组DNA样品，样品要求：
a样品纯度：OD260／280值应在1.7-2.0之间；RIxIA应该去除干净；不得有其它个体或其它物种的DNA污染；
b样品浓度：浓度不低于55 ng/ul；
c样品总量：每个样品总量不少于5叫；
d样品溶剂：溶解在TE中；
e样品运输：DNA冷冻运输；在运输过程中请将管口密封好，以防出现污染；
l 组织样品：组织≥100 mg，-80℃保存，冷冻运输；
l 血液样品：全血≥1.0 ml，-80℃保存，冷冻运输；
l 细胞样品：细胞数≥106个，-800C保存，冷冻运输。
报告形式
l 实验文件：主要实验步骤、DNA质检报告；
l 实验图像：芯片扫描图：
l 实验数据：原始数据和处理的数据（甲基化总表、差异甲基化基因的功能分析、差异甲基化基因的pathway分析、Diffscore筛选、DeltaBeta筛选等）。
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