磷酸化蛋白质组鉴定

  蛋白质磷酸化是生物体中最常见、最重要的一种蛋白质翻译后修饰方式，它可以通过激发、调节诸多信号通路进而参与调控生物体的生长、发育、逆境应激、疾病发生等多种生命过程，所以磷酸化一直是生物学研究的重点与热点。

　　磷酸化蛋白质组全谱鉴定以组织、细胞等较为复杂样本为研究对象，目的在于鉴定样品中发生磷酸化的蛋白质以及相应的磷酸化位点。首先对蛋白样本进行酶解，TiO2或IMAC-Fe或IMAC-Ti富集磷酸化多肽，5600-plus质谱检测，利用得到的质谱谱图与相应数据库搜索比较，从而得到肽段序列结果，同时通过生物信息软件计算出磷酸化位点。对于磷酸化位点鉴定，为了增加定位修饰位点的准确性，金开瑞采用较流行的Ascore算法对发生在各位点的磷酸化修饰做进一步打分评估，从而正确辨别真实修饰位点。

  金开瑞可您的需求，进行根据客户需求，提供磷酸化蛋白质组鉴定服务。

一、服务特色

技术特点

采用主流的TiO2 / IMAC富集方法，特异性高，富集效率好；

通过高分辨率、高扫描速度的质谱，对富集的磷酸化肽段进行大规模鉴定；

结合常用的定量技术可对不同样品间的磷酸化水平的差异进行定量比较。

 

适用范围

已知物种基因组序列、ESTs序列或蛋白质序列全库

无其他特别要求

二、服务说明

 

服务流程

接受订单及样品——蛋白提取——肽段酶解——TiO2富集——HPLC分离——LC-MS/MS——生物信息分析——结果交付

客户提供

需鉴定的样品；

样品信息单，需详细填写样品来源、含量、状态及其他基本信息。

 

最终交付

实验报告一份，含具体实验流程及蛋白质组鉴定及定量结果（生物信息学分析）。

生物信息学分析内容包括：

1. 修饰蛋白、修饰位点鉴定；

2. 鉴定结果特征分布：肽段长度、蛋白覆盖度分布、unique肽段分布；

3. 修饰位点motif预测；

4. 蛋白质GO功能分类、COG注释、Pathway通路注释；

5. 蛋白质网络互作预测（高级分析）

6. 蛋白质Domain预测（高级分析）

7. 磷酸化蛋白激酶预测（高级分析）

 

三、服务周期及报价

服务周期

自送样起45个工作日。

 

服务报价

请询价。

 

如对磷酸化蛋白质组鉴定感兴趣或者需要技术支持，请您与我联系QQ：3013422302，或者浏览我们公司的网站http://www.genecreate.cn/，可以搜索到您想要的服务信息，武汉金开瑞生物工程有限公司期待和您的合作。

武汉金开瑞生物工程有限公司位于武汉国家生物产业基地，是一家专业致力于为全球制药企业、诊断试剂企业、科研试剂研发企业、高校和科研院所以及大型医院提供蛋白及相关研究技术服务的高新技术企业。
关注蛋白整体研究思路，围绕蛋白的读、解、写、用，金开瑞建立起蛋白组、检测分析、基因服务、病毒包装、蛋白表达、抗体制备六大核心技术平台。所有平台的实验室及技术团队都坚持自主建设，各平台技术负责人都有5年以上相关领域的工作经验，可以最大程度的保障了项目按时保质的实施。完整的技术平台及专业的技术团队，保证了金开瑞不仅可以提供单一项目的技术服务，还可以提供miRNA，lncRNA，蛋白质组学相关等多种整合性项目服务。
“读”——对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的序列解读，定量、定位检测；
“解”——采用基因手段（干预、敲除或过表达）对预测的蛋白信息进行确证和深入分析；
“写”——通过体外重组方法制备，并通过系列实验确认其结构与功能尽可能的接近天然状态；
“用”——与客户合作讲蛋白的检测和合成领域的成果开发到市场需求标准的产品或平台。
六大技术平台：
蛋白质组分析平台——iTRAQ、SWATH、SILAC、Label-free，各种蛋白质组定量技术协助您发现信号转导通路关键蛋白、发现疾病标记物、发现药物靶标。
检测分析平台——通过免疫学分析方法（WB、IHC、IF、IP、ChIP、ELISA等），获得蛋白定量、定位等各种信息，确定您的目标蛋白。
基因服务平台——立足中心法则，围绕DNA/RNA/蛋白质开展全方位基因研究服务，合成&测序、载体构建、定点突变、qRT-PCR、RACE、CRISPR/Cas9……助您全面奠定蛋白研究基础。
病毒包装平台——13000种人源克隆库，各种功能载体，提供慢病毒、腺病毒、腺相关病毒包装及慢病毒稳转细胞株筛选服务，是您进行基因功能研究的绝佳助手。
蛋白表达平台——提供从基因合成到蛋白表达的一站式服务，史上最全的六大表达系统，噬菌体展示技术，帮助您获得任意想要的蛋白。
抗体定制平台——单/多克隆抗体、人源化抗体、基因工程抗体、双特异性抗体、修饰抗体、诊断抗体、小分子抗体、抗体对……真正保证型应用型抗体定制，只有您想不到，没有我们做不到。

金开瑞坚持“以客户为中心”，专注于蛋白及相关研究，致力于做您最贴心的蛋白研究合作伙伴。