对于SNP,我们LDR的方案最为成熟,因此现在很多公司都放弃了原来的方案(如单碱基延伸),转而做LDR。因为LDR直观,稳定。我们是国内最先做LDR方案的公司,至今有8年了。有大量的经验。
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服务商: 上海翼和应用生物技术有限公司 | 查看该公司所有服务 >> |
翼和经典服务项目|SNP基因分型
根据具体实验规模翼和提供两种检测平台,分别为:中低通量检测的PCR-LDR SNP分型服务(样本量与位点数较少)和高通量的基于二代测序的Hi-SNP分型服务(样本量与位点数较多)。
PCR-LDR SNP分型服务
PCR-LDR技术是PCR技术和LDR(Ligase Detection Reaction,连接酶检测反应)相结合的检测技术。
LDR是利用高温连接酶实现对基因多态性位点的识别。高温连接酶一旦检测到DNA与互补的两条寡聚核苷酸接头对应处存在着基因点突变类型的碱基错配,则连接反应就不能进行,反之则可以进行连接反应。
该检测技术适合各类中低通量的SNP检测规模,如QTL定位研究路线、候选基因或位点关联分析、分子育种等。
Hi-SNP分型服务
Hi-SNP结合多重PCR技术和高通量测序技术,对需要检测的位点设计特异性引物,在单管内进行多重PCR扩增,不同的样本以不同的Barcode引物区分。混合样本后,在illumina 测序平台上,对扩增子进行高通量测序。测序结果使用生物信息学方法,区分不同的样本,最终获得每个位点的SNP信息。高通量测序能一次对几百万条DNA分子进行序列测定,相比其他的SNP检测技术,基于高通量测序的SNP分型具有更准确、更灵敏的特点。
该检测技术适用于很多的遗传学研究领域,例如疾病基因组研究、肿瘤基因组研究、疾病与基因的关联研究、临床分子诊断研究等,在植物基因组研究中,可用于QTL定位及分子育种,非常适合大规模样品的SNP分析。
翼和分型服务的整体流程
翼和具备标准的SNP实验服务流程,通过如下质量控制环节体系,保障SNP数据的真实性和完整性。