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采用Agilent 提供的eArray 在线设计软件设计探针--定制Agilent sure select kit---建库及杂交—cluster 制备—GA 测序—基本数据处理—生物信息分析
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一、测序策略及技术路线
采用Agilent 最新的捕获试剂盒进行序列捕获。
技术方法和路线：采用Agilent 提供的eArray 在线设计软件设计探针--定制Agilent sure select kit---建库及杂交—cluster 制备—GA 测序—基本数据处理—生物信息分析
1. 样品检测
1) NanoDrop 2000 分光光度计
2) 琼脂糖电泳
3) Agilent2100（可选）
2. 文库制备
采用液相杂交技术：Agilent Sure-Select™液相杂交系统
基因组DNA 的随机打断
↓
DNA 片段的末端修复和接头的连接
↓
PCR 扩增文库
↓
液相探针杂交捕获目的片段
↓
PCR扩增捕获的DNA片段
↓
捕获效率的检测
↓
测序文库的检测
↓
Genome AnalyzerⅡx测序
3. 上机测序
GAIIx测序，100PE， 每个样本产出数据不低于400M
4. 生物信息分析
a) 原始数据产出统计；
b) 基因组单碱基深度及覆盖度分析；
c) 一致序列组装
d) SNP检测及其在基因组的分布
二、 样品要求
1. 样品总量：每次外显子捕获需要大于15μg的样品，为保证实验质量及延续性，请一次性提供至少30μg样品；
2. 样品纯度：OD260/280值在1.8～2.0 之间；
3. 样品浓度：不低于200ng/ul；
4. 样品保存：选择酒精、TE buffer或超纯水一种，请在样品信息单中注明；
5. 样品运输：样品请置于1.5 ml管中，做好标记，使用封口膜封好，并同《样品信息单》一起放到塑料样品袋中封口。建议使用干冰或冰袋运输，并选择较快的运输方式。
三、完成时间及标准
1. 客户提供待测基因组样本和感兴趣的基因区域列表（要求有参考基因组序列），我方完成探针定制、杂交、测序和生物信息分析整套流程。探针定制成功后3个月完成。
2. 由客户进行探针设计和定制，交给我方进行文库构建、杂交及测序分析工作。2个月完成。
四、 价格
说明
1. 因Agilent芯片定制的最小包装为10RXN/kit，因此，样品数不足10的整数倍的，按照10的整数倍计算探针定制费用。（例：11个样品按照20个样品计费。
若需更多信息请与我们联系
电话：4001869509
邮箱：marketing@kangpusen.com
网址：www.kangpusen.com
