 |
Illumina GAiix 能够对样品中的全部Small RNA 进行深度测序，达到定性定量的研究目的。
|
|||||||||||||||||
| [发表评论] [本类其他服务] [本类其他服务商] | ||||||||||||||||||
| 服务商： 北京康普森生物技术有限公司 | 查看该公司所有服务 >> |
SmallRNA 是生命活动重要的调控因子，在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用。Illumina GAiix 能够对样品中的全部Small RNA 进行深度测序，达到定性定量的研究目的。每个样品可得到3 Million 以上的Small RNA 测序序列。通过大量的平行测序，可以发掘、鉴定并定量出任何物种全基因组水平的小RNA 图谱、新miRNA 分子的挖掘、靶基因的预测和鉴定和样品间差异表达分析等科学应用。
小RNA测序实验流程：样品检测--样品制备--cluster制备--上机--基本数据处理--生物信息分析
小RNA测序生物信息分析：
1) 数据产出统计
2) 去除低质量、污染及接头后的序列长度分布统计；
3) 不同样本间的序列情况统计；
4) 与参考序列比对情况统计（需甲方提供参考序列信息）；
5) 与已发布miRNA数据库的比对统计；
6) 与已发布rRNA数据库的比对统计；
7) 重复序列注释统计；
8) 与mRNA、exon、intron的相关度统计；
9) 小RNA注释统计；
10) 新的miRNA预测；
11) 不同样本间的差异统计分析；
12) 靶基因预测；
小RNA测序样品要求：
1.请自由选择样品RNA的提取方法，如Trizol法、商业化试剂盒等（用于小RNA测序的总RNA建议使用专业的抽提试剂盒或trizol抽提沉淀法），但请勿使用LiCl沉淀，同时满足样品质量和总量要求。
2.请在样品提供电泳胶图或Aglient Bioanalyzer中一种或两种形式的样品分析结果。
3.样品质量要求：经过DNA酶处理（小RNA测序样品不需要DNA酶处理），OD260/280为1.8-2.2，完整性良好，如使用Agilent Bioanalyzer仪器检测，则获得的总RNA应 28S:18S≥1，RIN≥8。
4.针对不同的应用，样品浓度及总量要求如下：
a)DGE测序样品：浓度≥200 ng/μl、总量≥10μg（动物样品总量≥8μg）;
b)转录组样品：浓度≥600ng/μl、总量≥20 μg;
c)Small RNA测序样品：浓度≥400ng/μl、总量≥30μg。
d)建议在条件允许情况下，提供可供两次样品制备的量，以确保实验质量及延续性
5.样品保存条件：选择Trizol、DEPC水一种，请在样品信息单中注明。
6.样品运输：样品请置于1.5 ml管中，使用封口膜封好。使用足量的干冰运输，并选用较快的运输方式，以降低运输过程中样品降解的可能性。
若需更多信息请与我们联系
电话：4001869509
邮箱：marketing@kangpusen.com
网址：www.kangpusen.com
