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高通量测序服务——Small RNA深度测序
第二代测序省去了小RNA克隆文库构建过程,可以一次性产生上百万条小RNA序列,能够快速鉴定特定条件下的表达的已知Small RNA并发现新的小RNA,同时还可以研究不同条件下小RNA的表达差异。
服务类别:测序/合成总访问:2108
最后更新:2015-7-14半年访问:19
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高通量测序服务——Small RNA深度测序

详细描述:
Small RNA是一类长度在20~30nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA。Small RNA能够调控基因的表达,在细胞的生长、发育、代谢等基础生物学过程中扮演着重要的角色,甚至在癌症等相关疾病形成过程中起着关键的作用。第二代高通量测序技术省去了烦琐的Small RNA克隆文库构建过程,可以一次性产生上百万条Small RNA序列,能够快速鉴定特定条件下的表达的已知Small RNA并发现新的Small RNA,同时还可以研究不同条件下Small RNA的表达差异。
 
美吉优势
1.      拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台,可以根据合作伙伴要求灵活安排实验,实验周期短,质量可靠。
2.      技术人员经验丰富,可以根据合作伙伴要求在第一时间提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。
3.      拥有专业的生物信息团队和大型计算机,可以为合作伙伴提供个性化的生物信息分析服务。
 
生物信息分析
1.      序列去杂(去除接头序列、简单序列等)
2.      Rfam数据库以及Genbank数据库比对,去除rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA的降解片段
3.      鉴定mRNA的降解片段
4.      同miRNA数据库比对,鉴定miRNA
5.      同参考基因组比对,预测新的miRNA
6.      分析两个样品miRNA的表达差异
7.      miRNA表达模式聚类分析
8.      预测miRNA靶基因
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