单细胞及微量样本的DNA甲基化组学研究很大程度上受制于建库技术。传统的文库构建方法或类似于基因组DNA的单细胞扩增技术很难应用到甲基化实验过程中。易基因建立了一系列微量及单细胞甲基化检测方法,可对于不同项目需求,个性化提供检测方案,在全基因组、简化基因组、靶基因等范围开展甲基化检测。
易基因建立的单细胞及微量样本DNA甲基化测序技术包括:
- 单细胞全基因组甲基化测序(scWGBS)
- 单细胞简化基因组甲基化测序(scXRBS)
- 微量样本全基因组甲基化测序(Micro DNA-WGBS)
- 微量细胞或DNA简化基因组甲基化测序(Micro DNA-XRBS)
应用方向:
单细胞及微量珍稀样本的甲基化研究主要应用于肿瘤发生机制,癌症研究,胚胎植入前诊断,胚胎早期发育,生殖细胞重组,干细胞及细胞异质性等研究领域。应用的样本包括单细胞、微量细胞、微量DNA等。特别适用于难以取得的珍稀样本和细胞异质性较大的组织样本。
技术优势:
1)微量细胞或单细胞全基因组甲基化测序(Micro DNA-WGBS)DNA起始量:
单细胞/100-1000个细胞
1ng基因组DNA
90%以上基因组CG覆盖
2)微量细胞或DNA简化基因组甲基化测序(Micro DNA-XRBS)DNA起始量:
1ng基因组DNA;
10-20M有效CG位点覆盖;
20G测序数据量。
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深圳市易基因科技有限公司(简称易基因,E-GENE Co.,Ltd.)以“引领表观遗传学科学研究与临床应用”为愿景,依托高通量测序技术和云数据分析平台。为医疗机构、科研机构、企事业单位等提供以表观遗传学技术为核心的多组学科研服务及解决方案,全面覆盖针对生命科学基础研究、医学及临床应用研究等内容。 易基因专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务。技术团队在国际上首创LHC-BS、HMST-seq、ChIP-BS、cfDNA-TBS等甲基化、羟甲基化技术流程,研发建立简化基因组甲基化dRRBS、cfDNA-RBS,单细胞/微量DNA全基因组甲基化及简化高通量甲基化测序技术,RNA甲基化测序等技术和方法,并建立易基因科技全自动化弹性资源生信分析系统。在Nature、Lancet、Science、Nat Commun、 Cell Res、Genome Biol、Blood、PloS Genet、Epigenetics、Epigenomics 、Clin Epigenetic等著名期刊发表论文100余篇,申请发明专利12项、软件著作权27项。