cfDNA片段化严重,片段大小常在150bp左右,现有甲基化检测技术包括cfMeDIP和微量WGBS等。无法做到碱基分辨、具有抗体特异性和非特异性捕获、覆盖深度低、检测成本高等特点。常规RRBS富集约70-350bp范围酶切片段,如对于CG含量高的片段将被切割的更碎而无法检测,保留下来的片段反而是CG含量低,无甲基化信息的基因片段。
易基因研发cfDNA-RBS技术,特异性捕获CCGG位点两端的DNA,通过亚硫酸盐测序,实现高深度,单碱基分辨检测CG位点甲基化信息。DNA起始量仅需5ng,是目前肿瘤甲基化标志物检测研究的优选技术,应用场景包括肿瘤早筛、肿瘤诊断、个性化用药、实时监控、预后监测等。
技术优势:
- 超低起始量:100-500ul血浆或5ng cfDNA;
- 测序覆盖度高:20G测序数据,可达10M的CG位点覆盖,涵盖CpG岛、启动子、增强子、CTCF结合位点等多种核心调控区域
- 单碱基分辨率:在其覆盖范围内可精确分析每一个C碱基的甲基化状态;
- 性价比高:成本相对于现有技术大幅降低。
应用场景:
- 癌前病变的癌变预警标志物检测
- 肿瘤早期筛查标志物检测
- 肿瘤预后标志物检测
- 药物疗效预测标志物检测
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深圳市易基因科技有限公司(简称易基因,E-GENE Co.,Ltd.)以“引领表观遗传学科学研究与临床应用”为愿景,依托高通量测序技术和云数据分析平台。为医疗机构、科研机构、企事业单位等提供以表观遗传学技术为核心的多组学科研服务及解决方案,全面覆盖针对生命科学基础研究、医学及临床应用研究等内容。 易基因专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务。技术团队在国际上首创LHC-BS、HMST-seq、ChIP-BS、cfDNA-TBS等甲基化、羟甲基化技术流程,研发建立简化基因组甲基化dRRBS、cfDNA-RBS,单细胞/微量DNA全基因组甲基化及简化高通量甲基化测序技术,RNA甲基化测序等技术和方法,并建立易基因科技全自动化弹性资源生信分析系统。在Nature、Lancet、Science、Nat Commun、 Cell Res、Genome Biol、Blood、PloS Genet、Epigenetics、Epigenomics 、Clin Epigenetic等著名期刊发表论文100余篇,申请发明专利12项、软件著作权27项。