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高通量单细胞甲基化测序技术介绍(sc-RBS)
与常规RRBS不同,高通量单细胞甲基化测序sc-RBS由于从单个细胞输入的DNA量很少,常规方法不能保证目标DNA在最后的扩增过程中保持不变,因此sc-RBS在降损方面进行细化。
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最后更新:2023-2-10半年访问:17
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与常规RRBS不同,高通量单细胞甲基化测序sc-RBS由于从单个细胞输入的DNA量很少,常规方法不能保证目标DNA在最后的扩增过程中保持不变,因此sc-RBS在降损方面进行细化。易基因建立的高通量单细胞甲基化测序sc-RBS技术无需纯化,通过限制性内切酶消化、接头连接过程和在单管中转化重亚硫酸盐,是一种专注于将纯化过程中发生的损失降至最低的方法。
 
应用方向:
  1. 细胞发育:生殖细胞或胚胎细胞的成熟受到特定基因表达的影响,这与DNA中的甲基化水平相关。
  2. 疾病相关研究:在各种疾病中(尤其癌症),具有正常细胞所不具有的DNA甲基化模式,从而导致基因表达水平的差异。
  3. 珍稀样本:高通量单细胞甲基化测序特别适用于难以取得的珍稀样本和细胞异质性较大的组织样本。
 技术优势:
  • 起始量:单细胞或1-10个细胞;
  • 分辨率高:单碱基分辨率;
  • 细胞检测通量高:可对上百成千个单细胞进行甲基化检测
  • CG覆盖位点高:CG位点覆盖可达4-8M;
  • 性价比高:单个细胞检测费用低至千余元。
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