与常规RRBS不同,高通量单细胞甲基化测序sc-RBS由于从单个细胞输入的DNA量很少,常规方法不能保证目标DNA在最后的扩增过程中保持不变,因此sc-RBS在降损方面进行细化。易基因建立的高通量单细胞甲基化测序sc-RBS技术无需纯化,通过限制性内切酶消化、接头连接过程和在单管中转化重亚硫酸盐,是一种专注于将纯化过程中发生的损失降至最低的方法。
应用方向:
- 细胞发育:生殖细胞或胚胎细胞的成熟受到特定基因表达的影响,这与DNA中的甲基化水平相关。
- 疾病相关研究:在各种疾病中(尤其癌症),具有正常细胞所不具有的DNA甲基化模式,从而导致基因表达水平的差异。
- 珍稀样本:高通量单细胞甲基化测序特别适用于难以取得的珍稀样本和细胞异质性较大的组织样本。
技术优势:
- 起始量:单细胞或1-10个细胞;
- 分辨率高:单碱基分辨率;
- 细胞检测通量高:可对上百成千个单细胞进行甲基化检测
- CG覆盖位点高:CG位点覆盖可达4-8M;
- 性价比高:单个细胞检测费用低至千余元。
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深圳市易基因科技有限公司(简称易基因,E-GENE Co.,Ltd.)以“引领表观遗传学科学研究与临床应用”为愿景,依托高通量测序技术和云数据分析平台。为医疗机构、科研机构、企事业单位等提供以表观遗传学技术为核心的多组学科研服务及解决方案,全面覆盖针对生命科学基础研究、医学及临床应用研究等内容。 易基因专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务。技术团队在国际上首创LHC-BS、HMST-seq、ChIP-BS、cfDNA-TBS等甲基化、羟甲基化技术流程,研发建立简化基因组甲基化dRRBS、cfDNA-RBS,单细胞/微量DNA全基因组甲基化及简化高通量甲基化测序技术,RNA甲基化测序等技术和方法,并建立易基因科技全自动化弹性资源生信分析系统。在Nature、Lancet、Science、Nat Commun、 Cell Res、Genome Biol、Blood、PloS Genet、Epigenetics、Epigenomics 、Clin Epigenetic等著名期刊发表论文100余篇,申请发明专利12项、软件著作权27项。