N1-甲基腺苷(N1-methyladenosine,m1A)是一种普遍存在于真核生物tRNA、rRNA和mRNA且可逆的转录后RNA修饰。基于高通量测序技术最新研究揭示m1A RNA修饰在基因调控和生物过程中的关键作用:对RNA稳定性和翻译起始等过程有着重要调节作用,广泛参与多种疾病的发生和发展。
m1A RNA修饰的检测,易基因采用基于抗体富集的甲基化RNA免疫沉淀测序方法(MeRIP-seq/m1A-seq),该技术利用m1A特异性抗体富集发生m1A修饰的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),结合高通量测序,对RNA上的m1A修饰进行定位与定量,总RNA起始量可降低至10μg,最低仅需1μg总RNA。
易基因提供适用于不同科研需求的m1A-seq技术:
- m1A甲基化-常量mRNA 甲基化测序(m1A-seq)
- m1A甲基化-常量mRNA +lncRNA甲基化测序(lnc-m1A-seq)
- m1A甲基化-微量mRNA +lncRNA甲基化测序(Micro-lnc-m1A-seq)
技术优势:
- 起始量低:样本起始量可降低至10-20μg,最低仅需1μg总RNA;
- 转录组范围内:可以同时检测mRNA和lncRNA;
- 样本要求:可用于动物、植物、细胞及组织的m1A检测;
- 重复性高:IP富集重复性高,最大化降低抗体富集偏差
- 应用范围广:广泛应用于组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克或DNA损伤应答、癌症的发生与发展、药物应答等研究领域。
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深圳市易基因科技有限公司(简称易基因,E-GENE Co.,Ltd.)以“引领表观遗传学科学研究与临床应用”为愿景,依托高通量测序技术和云数据分析平台。为医疗机构、科研机构、企事业单位等提供以表观遗传学技术为核心的多组学科研服务及解决方案,全面覆盖针对生命科学基础研究、医学及临床应用研究等内容。 易基因专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务。技术团队在国际上首创LHC-BS、HMST-seq、ChIP-BS、cfDNA-TBS等甲基化、羟甲基化技术流程,研发建立简化基因组甲基化dRRBS、cfDNA-RBS,单细胞/微量DNA全基因组甲基化及简化高通量甲基化测序技术,RNA甲基化测序等技术和方法,并建立易基因科技全自动化弹性资源生信分析系统。在Nature、Lancet、Science、Nat Commun、 Cell Res、Genome Biol、Blood、PloS Genet、Epigenetics、Epigenomics 、Clin Epigenetic等著名期刊发表论文100余篇,申请发明专利12项、软件著作权27项。