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精准DNA甲基化/羟甲基化测序(oxBS-seq)
羟甲基化5hmC是哺乳动物基因组上的第六碱基,在发育、衰老、神经退行性疾病、复杂疾病及肿瘤发生过程中起重要作用。
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最后更新:2023-2-10半年访问:16
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羟甲基化5hmC是哺乳动物基因组上的第六碱基,在发育、衰老、神经退行性疾病、复杂疾病及肿瘤发生过程中起重要作用。DNA羟甲基化是近年发现的一种新的DNA修饰并迅速成为研究热点。随着研究的深入,发现之前被认为是检测DNA甲基化标准的重亚硫酸盐测序并不能区分DNA甲基化(5mC)和DNA羟甲基化(5hmC)。
 
易基因联合剑桥大学建立了化学氧化法结合重亚硫酸盐转化的测序技术(oxidative bisulfite sequencing, oxBS-Seq),该技术不仅可以精确检测DNA甲基化,排除DNA羟甲基化的影响,还可以双文库结合同时单碱基分辨率精确检测DNA羟甲基化。
 
传统BS转化无法区分5mC和5hmC
传统的Bisulfite测序中,5hmC经过Bisulfite处理后变为CMS,CMS在测序中仍然被读作C碱基,因此不能区分5mC和5hmC。
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