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QPCR
实时荧光定量PCR
服务类别:测序/合成总访问:114
最后更新:2022-11-15半年访问:5
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二、操作步骤
1RNA提取
对于贴壁细胞样本
(1)用移液器小心吸去培养基,加入1mL 4℃预冷的PBS溶液,小心摇晃洗去残余培养基,用移液器吸尽PBS溶液,加入1mL Trizol溶液,反复吹打培养瓶/培养基底部及四周,将细胞充分吹打到Trizol中。加入250μL三氯甲烷,充分混匀,冰上静置5min。
(2)混合液4℃,10000g,10min离心。超净工作台中小心吸取上清500μL于1.5mL EP管中,加入等体积4℃预冷的异丙醇,颠倒混匀,-20℃静置15min。
(3)溶液4℃,10000g,10min离心,小心倒掉液体,加入1mL 4℃预冷的75%乙醇,颠倒数次,清洗RNA沉淀,4℃,10000g,5min离心,倒掉液体,于超净工作台中干燥数分钟,将乙醇充分挥发干净,加入10μL RNase-Free Water,充分溶解RNA。
对于悬浮细胞样本
(1)低速离心收集细胞,加入适当体积的冷却的PBS缓冲液重悬,300g离心10 min,吸除上清。重复以上操作两次,收集细胞沉淀。加入1mL Trizol溶液,反复吹打将细胞充分吹打到Trizol中加入250μL三氯甲烷,充分混匀,冰上静置5min。
(2)混合液4℃,10000g,10min离心。超净工作台中小心吸取上清500μL于1.5mL EP管中,加入等体积4℃预冷的异丙醇,颠倒混匀,-20℃静置15min。
(3)溶液4℃,10000g,10min离心,小心倒掉液体,加入1mL 4℃预冷的75%乙醇,颠倒数次,清洗RNA沉淀,4℃,10000g,5min离心,倒掉液体,于超净工作台中干燥数分钟,将乙醇充分挥发干净,加入10μL RNase-Free Water,充分溶解RNA。
对于组织样本
(1)标本于-80℃或液氮中保存,用已经消毒的工具于冰上取约100mg组织,于1mL 预冷的Trizol中充分研磨,匀浆液小心倒入1.5mL EP管中,加入250μL三氯甲烷,充分混匀,冰上静置5min。
(2)混合液4℃,10000g,10min离心。超净工作台中小心吸取上清500μL 于1.5mL EP管中,加入等体积4℃预冷的异丙醇,颠倒混匀,-20℃静置15min。
(3)溶液4℃,10000g,10min离心,小心倒掉液体,加入1mL 4℃预冷的75%乙醇,颠倒数次,清洗RNA沉淀,4℃,10000g,5min离心,倒掉液体,于超净工作台中干燥数分钟,将乙醇充分挥发干净,加入10μL RNase-Free Water,充分溶解RNA。
对于血液样本
(1)取500μL全血于15mL离心管中,加入10倍体积红细胞裂解液,混匀,室温避光静置10min。
(2)室温,300g,离心10min,弃上清,重复步骤(1),室温,300g,离心10min,弃上清。
(3)PBS重悬细胞沉淀,室温,300g,离心10min,弃上清,100μL PBS重悬细胞,加入1mL Trizol,混匀,静置5min,加入250μL三氯甲烷,充分混匀,冰上静置5min。
(4)混合液4℃,10000g,10min离心。超净工作台中小心吸取上清500μL 于1.5mL EP管中,加入等体积4℃预冷的异丙醇,颠倒混匀,-20℃静置15min。
(5)溶液4℃,10000g,10min离心,小心倒掉液体,加入1mL 4℃预冷的75%乙醇,颠倒数次,清洗RNA沉淀,4℃,10000g,5min离心,倒掉液体,于超净工作台中干燥数分钟,将乙醇充分挥发干净,加入10μL RNase-Free Water,充分溶解RNA。
 
2、第一链cDNA合成
第一链cDNA的合成采用PrimeScript™RT reagent Kit with gDNA Eraser进行(TaKaRa公司),主要步骤如下:
(1)在冰上配置如下反应液,以除去基因组DNA。
试剂 使用量
5*gDNA Eraser Buffer 2.0 μL
gDNA Eraser 1.0 μL
RNA 10.0μL
 
PCR仪上42℃ 2 min
        4℃
(2)在冰上配置如下反应液
试剂 使用量
步骤1反应液
PrieScript RT Enzyme Mix Ⅰ 1.0 μL
RT Primer Mix 1.0 μL
5*PrimrScript Buffer 2 4.0 μL
RNase Free dH2O 4.0 μL
 
PCR仪上37℃ 15 min
                                  85℃ 5 sec
                                   4℃
3、荧光定量PCR
实时荧光定量PCR是在Life technologies公司的StepOne™ Real-Time PCR仪上完成,每个样品均作3个复孔,使用SYBR® Premix Ex Taq™试剂盒进行(TaKaRa公司):
(1)反应程序为:预变性 95℃,1min
循环(40次) 95℃,15s→58℃,20s→72℃,45s
熔解曲线 60℃→95℃,每20s升温1℃
 
(2)反应体系为:
试剂 使用量
2× qPCR Mix 5.0 μL
引物工作液(2.5μM) 1.0 μL
Template 1.0 μL
ddH2O 2.8 μL
Rox 0.2 μL
 
 
三、附录
1、数据分析方法
ΔΔCT法:
A=CT(目的基因,实验样本)- CT(内标基因,实验样本)
B=CT(目的基因,对照样本)- CT(内标基因,对照样本)
K=A-B
表达倍数=2-K
2、引物
(1)引物由武汉金开瑞生物工程有限公司合成
(2)序列如下:
引物名称 引物序列 产物长度(bp)
  Forward 5`--3`  
reverse 5`--3`
    5`--3`  
  5`--3`
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