环状RNA(circRNA)是一类特殊的非编码RNA分子,与传统的线性RNA(linear RNA)不同,circRNA分子合呈封闭环状结构,且不受RNA外切酶影响,表达更稳定,不易降解。华大推出环状RNA高通量测序服务,可进行环状RNA的鉴定以及环状RNA与miRNA‘’海绵效应‘’分析, 可实现ceRNA(competing endogenous RNAs,内源竞争RNA)机制等研究。可应用在物种环状RNA表达谱构建,环状RNA疾病生物标记开发,环状RNA作用机制研究等方面。
技术优势
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信息分析内容
一、标准信息分析
1. 基本数据统计
1.1去除接头序列、低质量序列得到clean data
1.2与核糖体数据库比对,去除核糖体RNA数据
2. 环状RNA预测鉴定
3. 环状RNA所在线性基因注释
4. 环状RNA在基因组上的定位
5. 环状RNA表达定量分析
6. 样品(组)间表达差异分析
二、高级信息分析
1. 差异环状RNA来源的基因GO功能及富集分析
2. 差异环状RNA来源的基因Pathway功能及富集分析
3. 环状RNA与miRNA互作分析(适用于人/小鼠物种)
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华大科技于2012年完成整合,致力于成为全球生命科学研究机构的首选科技服务商,为从事生命科学研究的机构和企业提供高质量、行业领先的基因测序、质谱、合成生物学、生物数据库、云计算等标准化的技术服务和综合的全流程解决方案。 目前,公司服务已经覆盖了全球100多个国家和地区,拥有7,000多位合作单位,为25,000多位行业联系人提供了杰出技术支撑与服务,更通过深度合作完成了一系列大型基因组科研计划和国际多边合作项目。科研积累上,截至2020年9月底,公司累计参与发表近1,500篇文章,其中CNNS 120+。截止2022年3月,华大自主测序平台DNBSEQTM 助力发表2,013+篇高质量文章,影响因子合计8,800+,并实现CNS三大主刊发文。