单细胞转录组测序,以单个细胞为特定研究对象进行转录组测序,并对获得的数据进行生物信息学统计分析的新技术。基于微流控和 barcode 标记等技术可实现大量大细胞的快速高效标记、测序和分析,获得单细胞水平的基因表达谱和差异情况,并通过对复杂细胞群体进行深入细致分析,绘制大规模单细胞表达图谱。
实验流程
应用方向
· 组织/器官细胞图谱的构建;
· 肿瘤细胞的异质性及微环境研究;
· 免疫组学研究;
· 神经分化发育研究。
数据分析
标准信息分析 |
高级信息分析 |
测序数据质控和定量 |
细胞亚群注释 |
细胞亚群分类 |
RNA速率 |
Marker基因分析 |
细胞通讯 |
差异基因富集分析 |
CNV分析(肿瘤样本) |
技术优势
· 超高的细胞通量,每个样本检测的细胞数可达1K-10K;
· 方便快捷,10分钟内可完成上万细胞的捕获;
· 灵敏度高,单细胞捕获效率高达65%;
· 可适性高,适合大部分细胞类型。
参考文献
1.Nowotschin S , Setty M , Kuo Y Y , et al. The emergent landscape of the mouse gut endoderm at single-cell resolution[J]. Nature, 2019.
2.Maynard A , Mccoach C E , Rotow J K , et al. Therapy-Induced Evolution of Human Lung Cancer Revealed by Single-Cell RNA Sequencing[J]. 2020.bio-equip.com
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