 |
指特定组织或细胞在特定状态下转录出的所有转录本信息的总和
|
|||||||||||||||||
| [发表评论] [本类其他服务] [本类其他服务商] | ||||||||||||||||||
| 服务商： 上海中科新生命生物科技有限公司 | 查看该公司所有服务 >> |
全转录组（Whole transcriptome），是指特定组织或细胞在特定状态下转录出的所有转录本信息的总和，基于二代测序平台，采用去核糖体链特异性和小片段富集筛选的建库方法，实现编码RNA和非编码RNA（miRNA, lncRNA, circRNA）的建库、测序、生物信息学分析及联合分析、ceRNA调控网络等，研究基因表达变化的同时分析非编码RNA对其调控作用，深入挖掘解读生命现象背后的转录与调控问题。
实验流程
应用方向
生物领域各个研究方面，如：
数据分析
应用方向
生物领域各个研究方面，如：
- 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等；
- 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；
- 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等；
- 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等；
数据分析
| 基础分析 | 互作网络分析 |
| 数据质控 | 靶基因分析 |
| 参考基因组比对 | ceRNA调控网络 |
| RNAs鉴定和预测 | 蛋白互作网络 |
| 表达及差异表达分析 |
技术优势
参考文献
1.Linjun, Hong, Ting, et al. Genome-Wide Analysis of Circular RNAs Mediated ceRNA Regulation in Porcine Embryonic Muscle Development.[J]. Frontiers in cell and developmental biology, 2019, 7:289-289.
2.Guoqiang F, Zhe W, Xiaoqiao Z, et al. ceRNA Cross-Talk in Paulownia Witches' Broom Disease[J]. International journal of molecular sciences, 2019.
- 数据丰富：一份样本可同时获得4种RNA（miRNA，lncRNA，mRNA，circRNA）的信息；
- 全面的关联分析：可以进行两两间关联分析和两者以上ceRNA网络调控分析，不仅可以解释生物学现象背后的网络调控机制，而且有助于缩小筛选范围，挖掘关键基因。
参考文献
1.Linjun, Hong, Ting, et al. Genome-Wide Analysis of Circular RNAs Mediated ceRNA Regulation in Porcine Embryonic Muscle Development.[J]. Frontiers in cell and developmental biology, 2019, 7:289-289.
2.Guoqiang F, Zhe W, Xiaoqiao Z, et al. ceRNA Cross-Talk in Paulownia Witches' Broom Disease[J]. International journal of molecular sciences, 2019.
手机版：全转录组
Copyright(C) 1998-2025 生物器材网 电话：021-64166852;13621656896 E-mail：info@bio-equip.com