全质粒测序,是指基于第二代高通量测序技术,对质粒的全基因组进行建库测序,利用生物信息分析手段,对测序数据进行测序深度、GC 含量以及质粒全序列组装分析。六月初北京勤科生物推出全质粒测序,让获取质粒序列更轻松。
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数据质控:去除接头污染和低质量数据;
与参考序列进行比对、统计测序深度及覆盖度;
序列拼接组装,交付质粒序列fasta格式文件。
注:以下情况可能会有拼接结果不好的风险:a. 质粒存在重复序列、高GC\AT结构;b. 质粒不纯(相似度太高的质粒无法通过本方法区分开)。
案例展示:
图1.测序成环质粒图
图2.质粒序列FASTA格式文件
送样要求:
纯菌:新鲜菌液≥200 μL,穿刺菌,冰袋运输;
质粒:浓度≥50 ng/μL,体积 ≥20 μL,主带明显、无降解无污染,务必用灭菌的双蒸水溶解;
信息单详细填写载体名称、质粒大小及抗性,擎科提供Amp,Kana两种抗生素。
寄样地址:(请联系当地销售经理寄送)
江苏省南京市江宁区乾德路9号大树科技2号楼五楼
高通量测序组(收) 13851793730
寄件须知:
冰袋保存寄送,建议选择顺丰快递,寄样时需要将《擎科生物高通量测序样品信息单-全质粒测序》(长按识别下方二维码)打印出来随样本一起寄送。