蛋白质组学(proteomics),是以蛋白质组为研究对象,研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,基于质谱平台(LC-MS/MS)获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。