宏基因组( Metagenome,也称微生物环境基因组 Microbial Environmental Genome, 或元基因组)是 1998 年由 Handelsman 等提出的,是环境中全部微小生物遗传物质的总和,它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因,目前主要指环境样品中的细菌和真菌的基因组总和。以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象,以功能基因筛选和/或测序分析为研究手段,以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法,主要应用于群落结构分析、环境中的基因功能分析、以及发掘新物种。
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