真核有参转录组测序

产品简介
真核有参转录组测序是对真核某个物种特定组织或细胞在某一状态下转录的所有mRNA测序，通过与参考基因组比对，既能得到不同生长发育或胁迫条件下基因表达水平变化，又可分析基因结构优化、可变剪切及SNP等，揭示特定生物学过程中的分子机制。

产品优势
可获取全面的mRNA信息；
与参考基因组比对，鉴定已知基因和预测新基因表达及结构信息；
优质的测序平台，价格低、周期短、性价比高。

技术路线


结果展示
基因表达水平分析
通过箱线图，可以查看单个样品基因表达水平分布的离散程度，直观比较不同样品的整体基因表达水平，此外，还可以评估生物学实验操作的可重复性和鉴定差异基因的准确性。

差异表达基因火山图
通过火山图可以快速筛选两组样品中差异基因表达，从而挖掘与生物学性状相关的关键差异表达基因。

差异表达基因聚类分析
将实验组和对照组的差异基因做层次聚类分析，将表达模式相同或相似的基因或者样本聚合到一起，从而识别未知基因或已知基因的功能。

GO富集分析
通过GO富集分析寻找与整个基因组背景相比显著富集的GO条目，深入挖掘差异基因的功能及所在的信号通路，筛选与表型性状相关的关键基因。

差异基因蛋白互作网络
根据差异基因注释结果，筛选表型相关的差异基因，结合STRING数据库收录的互作关系对，构建差异基因蛋白互作网络，从而挖掘决定表型性状的关键基因及调控网络。


常见问题
Q1.测序数据比对率较低的原因可能有哪些？
A：（1）参考基因组的组装质量较低；    （2）测序的样本物种与比对的参考基因组的亲缘关系较远；    （3）存在外源污染或者样本处理出现问题。

Q2.新基因预测有什么意义？
A：如果测序的样本物种非模式生物，现有的公共数据库的注释信息一般不完善，因此新基因预测有助于研究者挖掘新的基因和转录本。

Q3.数据分析过程中，比对到基因组多个位置的序列如何处理？
A：无法确定这些序列是哪个基因的转录本，因此这些序列在定量分析过程中默认被过滤掉。

北京果壳生物科技有限公司， 专注多组学与分子检测技术的研究和应用。公司成立于2017年，创始团队深耕基因检测领域，历任著名科研机构和上市公司骨干岗位。
公司在北京设有分子研发中心，占地面积约1500㎡，搭载Illumina iScan、NovaSeq 6000、10x Genomics、MassARRAY、KASP等中、高通量检测平台，为科研客户提供多组学研究的综合性解决方案。2020年，公司在成都建立临床医学检验所，具备临床基因扩增检验资质，占地面积约5000㎡，为西南地区较大的实验基地之一。拥有大规模基因组信息检测、数据分析能力，标准的质量控制流程，能够有效支撑临床实践过程中的检测项目实施需求。
果壳生物的基因芯片平台处于业内领先地位。公司先后自主研发ASA-CHIA芯片和GUOKE 50K芯片，广泛应用于科研队列研究和遗传病筛查领域，大大降低了分子诊断技术在终端的使用成本，目前检测能力高达10000例样本/周。
果壳生物目前已累计服务全国300余家科研院所、三甲医院，完成50万余份样本的基因检测工作，与全球近20位分子诊断领域的顶尖科学和医学专家建立深度合作，横跨基础研究、出生缺陷防控、个体化基因检测等多个领域，致力于让领先的基因组学检测技术发挥更大的应用价值。

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