sgRNA文库合成及CRISPR脱靶检测

　　随着基因编辑技术在基础研究、基因治疗、分子育种等多领域的快速推进和应用，如何正确预测、评估和降低脱靶效应的发生，如何对编辑后的脱靶情况进行有效验证和鉴定，成为了困扰众多基因编辑科研工作者的重要课题。iGeneTech^®具有行业顶尖的设计专家团队和国际领先的高通量、高保真、高均一性的sgRNA文库合成技术，致力于为基因组编辑领域的科研工作者提供优质、快速和精准的sgRNA设计合成方案，并精准预测脱靶位点，结合具有自主知识产权的捕获技术进行快速、准确和成本集约的脱靶位点鉴定。

 产品优势

　　CRISPR/Cas9系统广泛用于基因组编辑，但是这些核酸酶经常会导致不期望的off-target，而sgRNA很大程度上决定了编辑的特异性。华中农业大学与艾吉泰康联合开发了一款用户可自定义PAM的CRISPR sgRNA设计和脱靶效应评估软件--CRISPR-offinder。CRISPR-offinder设计的sgRNAs可以适配满足不同类型的RNA引导的DNA内切酶。该软件程序中包括4个部分：

a、设计sgRNAs，sgRNAs靶位点的长度为15-25nt；

b、PAM需求：默认的PAM和用户自定义PAM，用以确认PAM的序列、方向和坐标；

c、投入参数CRISPR-offinder提供两个选项用于输入基因或基因组序列；

d、非目标搜索参数。

　　CRISPR-offinder可以支持任意物种的sgRNA文库设计，不受该物种基因组组装状态的影响。实验表明，对于不同的CRISPR系统，包括最新发现的基因编辑方法，如Cpf1和C2c1，CRISPR-offinder设计得到的sgRNA均能有效降低脱靶效应。

图1 不同基因组编辑系统与CRISPR-offinder软件工作原理图

参考文献

Zhao C, Zheng X, Qu W, et al. CRISPR-offinder: a CRISPR guide RNA design and off-target searching tool for user-defined protospacer adjacent motif[J]. International Journal of Biological Sciences, 2017, 13(12):1470-1478.

　　公司以“做中国质造的基因捕获”为企业目标，专注于高通量测序靶向捕获技术的研发创新，现在已拥有液相探针捕获技术（TargetSeq^®）和多重PCR扩增子捕获技术（MultipSeq^®）两套自主知识产权的捕获技术，是国家级的高新技术企业。

　　公司以基因捕获技术造福生命健康为己任，以为生命而精准设计为愿景，业务已涵盖精准医疗、法医鉴定、大健康、公共卫生、公安司法和科学研究等各领域，已形成包含试剂盒与试剂组分、医院独立认证实验室（LDT）解决方案、科研服务、合成生物学等的多元化产品服务体系。为基因检测企业、政府职能机构、临床医院、大学和科研院所提供优质、高效、成本集约的试剂盒定制生产和捕获测序服务解决方案。