将重亚硫酸盐处理方法和Illumina高通量测序平台相结合,对有参考基因组的物种在全基因组水平进行高精准甲基化研究
|
||||||||||||||||||
[发表评论] [本类其他服务] [本类其他服务商] |
服务商: 北京诺禾致源科技股份有限公司 | 查看该公司所有服务 >> |
全基因组DNA甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS)是将重亚硫酸盐处理方法和Illumina高通量测序平台相结合,对有参考基因组的物种在全基因组水平进行高精准甲基化研究。WGBS可以达到单碱基分辨率,精确分析每一个胞嘧啶的甲基化状态,从而构建精细的全基因组DNA甲基化图谱。
基于全基因组重亚硫酸盐转化的WGBS法,实现单碱基分辨率的甲基化位点精准、高效定位。
精准获得全基因组甲基化的C位点,是甲基化测序的金标准;全面分析不同处理对全基因组甲基化水平的影响,快速准确地找到差异甲基化区域。具有“高效、精准、超值”的优势,已广泛应用于人和动植物研究。
从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。
诺禾致源的WGBS是基于全基因组水平,实现单碱基分辨率的甲基化位点精准定位,快速准确地找到差异位点,实现高效分析DMR及相关基因的功能分析。
WGBS | 分析内容 | 解决问题 |
标准分析 | 测序数据质量评估 | 过滤掉低质量数据,保证数据质量 |
与参考基因组比对 | 比对率和覆盖度分析 | |
甲基化位点calling | 分析甲基化位点 | |
甲基化分布 | 甲基化在基因组,染色体,功能元件上的分布 | |
差异甲基化分析 | 寻找DMR | |
相关基因分析 | 相关基因GO,KEGG富集分析 | |
多样本分析 | PCA分析多样本甲基化变化规律 |
全基因组甲基化测序采用先进的Illumina测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,以保证高效的数据处理和安全的数据存储。
诺禾致源已经成功完成对猪,大豆,食蟹猴,小鼠,扬子鳄,牛,涡虫,牡蛎,
拟南芥,水稻,杨树,白菜,蓝细菌等近百个物种进行全基因组甲基化测序分析,
助力客户在Genome Biology等权威杂志发表多篇高水平文章。
“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,
确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。