可针对样本中的miRNA、siRNA、piRNA展开全面分析,既能鉴定已知sRNA、也能预测新的sRNA并预测sRNA的靶基因,为研究small RNA功能及调控机制提供有力手段。
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服务商: 北京诺禾致源科技股份有限公司 | 查看该公司所有服务 >> |
Small RNA(sRNA)测序采用Illumina测序平台,可针对样本中的miRNA、siRNA、piRNA展开全面分析,既能鉴定已知sRNA、也能预测新的sRNA并预测sRNA的靶基因,为研究small RNA功能及调控机制提供有力手段。
Small RNA通过先进的测序平台,一次性可获得数百万条序列,结合先进的分析方法,可在全基因组水平快速鉴定和预测各种类型的Small RNA,得到与调控相关的所有基因。
从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。
诺禾致源small RNA测序项目,对已知和未知的small RNA进行系统分类注释,进而通过碱基编辑分析、表达水平分析以及靶基因预测,全面挖掘small RNA的调控功能。
分析内容 | 解决问题 |
参考序列比对 | 分析测序reads比对率和覆盖度 |
small RNA分类注释 | 筛选并鉴定鉴定已知的和新的sRNA |
碱基编辑分析 | miRNA种子序列分析 |
差异表达分析 | 样本间差异表达的sRNA |
靶基因预测 | sRNA作用的靶基因信息 |
差异 sRNA 靶基因 GO、KEGG富集 |
深入挖掘sRNA功能 |
Small RNA测序采用先进的Illumina测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,以保证高效的数据处理和安全的数据存储。
至2015年12月,诺禾致源已经成功对猪、牛、鼠、南极鱼、鲟鱼、红旗东方魨、大鲵、扬子鳄、梭子蟹、对虾、扇贝、海参、疟原虫、蝗虫等300多个物种进行small RNA测序分析,并在The Plant Cell、Scientific Reports等权威期刊发表文章20多篇。“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。