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参考基因组样本开展准确的circRNA鉴定以及来源基因的分析
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服务商: 北京诺禾致源科技股份有限公司 | 查看该公司所有服务 >> |
环状RNA(circular RNA, circRNA)是一类特殊的非编码RNA分析,测序采用Illumina测序平台进行测序,针对有参考基因组样本开展准确的circRNA鉴定以及来源基因的分析,环状RNA测序在医学、农学研究领域应用越来越广泛。
基于高通量测序,依据主流数据库和circRNA鉴定软件,分析项目物种的circRNA信息,深入挖掘circRNA在转录调控中所发挥的重要功能。
从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。
诺禾致源circRNA测序项目,通过高效富集circRNA,借助最主流软件对circRNA进行鉴定,并通过分析来源基因,以深化对项目物种circRNA的功能研究。
了解更多>>分析内容 | 解决问题 |
参考序列比对 | 分析测序reads比对率和覆盖度 |
circRNA鉴定 | 发现样本中存在的circRNA |
circRNA来源基因分析 | 有助于明确哪些基因能够形成circRNA |
circRNA表达水平定量 | circRNA在各个样本中的表达水平 |
差异表达分析 | 样本之间差异表达的circRNA |
GO、KEGG富集分析 | 明确来源基因的具体生物学功能 |
miRNA结合位点预测 | circRNA发挥海绵效应的基础 |
环状RNA测序采用先进的Illumina测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,以保证高效的数据处理和安全的数据存储。
至2015年12月,诺禾致源已经成功对人、鼠、羊、猪、鸡、斑马鱼、果蝇、家蚕、蜜蜂、线虫、拟南芥、油菜、水稻、棉花、稻瘟菌等30多个物种进行circRNA测序分析,做为一种相对较新的RNA测序产品,circRNA广受关注,大量研究成果发表在权威期刊。“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。