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宏转录组测序
从整体水平上研究某一特定环境,特定时期群体生命全部基因组转录情况以及转录调控规律的研究手段,它以生态环境中的全部RNA为研究对象,避开了微生物分离培养困难的问题,能有效的扩展微生物资源的利用空间
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最后更新:2020-10-16半年访问:14
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全方位解析微生物菌群动态变化

宏转录组(Metatranscriptome)测序是指从整体水平上研究某一特定环境,特定时期群体生命全部基因组转录情况以及转录调控规律的研究手段,它以生态环境中的全部RNA为研究对象,避开了微生物分离培养困难的问题,能有效的扩展微生物资源的利用空间。相较于宏基因组,宏转录组能从转录水平研究复杂微生物群落变化,能更好的挖掘潜在的新基因。

短周期,高通量,全分析。

诺禾致源宏转录组研究采用先进的测序平台,高通量覆盖可全面检测生态环境中的微生物信息,
充分挖掘样品中存在的微生物多样性及动态变化情况。具有“短周期、高通量、全分析”的优势,已广泛应用于肠道内容物、土壤、水体等研究中。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

信息分析

诺禾致源宏转录组测序项目,不仅进行基因表达情况以及差异基因表达分析,还进行物种注释及分类分析,多样品间的比较分析等。此外,诺禾致源提供个性化分析的服务,可以根据客户需求定制分析内容。

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De novo拼接
物种注释及分类
功能注释(KEGG,eggNOG,CAZy)
Nr数据库比对
GO富集
KEGG富集
多样品比较分析
悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

宏转录组采用先进的Illumina测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

出色完成每一个项目环节

至2016年5月,诺禾致源已经成功对土壤、污水、淤泥、昆虫肠道、口腔、粪便等多种生态环境中的微生物进行了宏转录组测序。
“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,
确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。

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