基于Illumina测序平台,构建链特异性文库,研究原核生物在某个时期或者在某种环境条件下转录出来的所有mRNA
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服务商: 北京诺禾致源科技股份有限公司 | 查看该公司所有服务 >> |
原核转录组测序是基于Illumina测序平台,构建链特异性文库,研究原核生物在某个时期或者在某种环境条件下转录出来的所有mRNA。由于原核生物mRNA没有polyA尾结构,需要采用去除rRNA的方法构建文库,诺禾致源针对不同的研究物种采取有效的方法去除rRNA,保证数据质量。
基于高通量测序,分析物种在特定条件下转录所得所有mRNA信息,系统全面的分析mRNA在结构和表达水平的变化,为原核生物的深入研究奠定基础。
从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。
诺禾致源原核转录组测序项目,除了基因表达以及差异基因之外,还包括多项基因结构水平的分析。此外,诺禾致源提供个性化分析的服务,可以根据客户需求定制分析内容。
基因结构水平分析 | 基因表达水平分析 |
参考基因组比对 | 参考基因组比对 |
新转录本预测 | 测序质量评估 |
UTR分析 | 基因表达水平分析 |
反义转录本预测 | 差异基因表达水平分析 |
sRNA分析 | 差异基因GO/KEGG富集分析 |
SNP和InDel分析 | 差异基因蛋白互作网络分析 |
可视化结果展示 |
原核转录组采用先进的Illumina测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,以保证高效的数据处理和安全的数据存储。
至2015年12月,诺禾致源已经成功对大肠杆菌、鲍曼不动杆菌、副溶血弧菌、荧光假单胞菌、牙龈卟啉单胞菌、水稻黄单胞杆菌、水稻条斑病菌、乳酸菌、链霉菌、发状念珠藻、小球藻、拟柱胞藻、嗜盐古菌等100多个物种进行原核转录组测序分析,并在该领域研究的权威期刊发表针对嗜盐古菌、产甲烷古菌等物种的mRNA研究成果。
“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,
确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。