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在不依赖参考基因组的情况下对某物种进行基因组测序及拼接组装，从而绘制该物种的全基因组序列图谱。
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基因组从头测序（De novo sequencing）
在不依赖参考基因组的情况下对某物种进行基因组测序及拼接组装，从而绘制该物种的全基因组序列图谱。基因组测序不仅可以获得该物种的全基因组序列图谱，同时也为后续物种起源进化及特定环境适应性的研究奠定了基础。根据基因组的复杂程度，基因组可分为简单基因组和复杂基因组。
| 简单基因组 | 复杂基因组 | |
| 重复序列比例 | ＜50% | ＞50% |
| 杂合率 | ＜0.5% | ＞0.5% |
从材料选取，建库测序，到数据分析，每一步都需要科学、缜密的设计，以保障高质量研究成果。
| 简单基因组de novo 测序 | 复杂基因组de novo 测序 | |
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纯二代 |
基于顶尖组装水平，简单或复杂基因组高质量组装 |
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文库类型 |
小片段文库：250 bp/450 bp |
小片段文库：250 bp/350 bp/450 bp |
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样本要求 |
DNA总量>400ug |
DNA总量>400ug |
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测序策略与深度 |
HiSeq PE150 100× |
HiSeq PE150 200× |
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承诺指标 |
哺乳动物和鸟类基因组：contig N50≥40 Kb |
contig N50≥20 Kb |
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组装策略（推荐） |
二代、三代混合拼接 |
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测序策略与深度 |
二代小片段（100×）+三代（40×）+10X Genomics |
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承诺指标 |
contig N50≥500 Kb |
contig N50≥200 Kb |
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全三代拼接 |
全三代结合新技术，组装水平达到新高度 |
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测序策略与深度 |
三代（80×）+10x Genomics／BioNano／ChiCago |
三代（100×）+10X Genomics／BioNano／ChiCago |
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承诺指标 |
contig N50≥1 Mb |
contig N50≥500 Kb |
基因组序列是研究物种分子生物学的基础，通过全基因组de novo测序，可得到物种全基因组序列图谱，通过比较基因组学分析可对物种进行基因家族分析，系统进化分析，正选择分析和共线性分析。
| De novo 测序 | 分析内容 | |
| 组装 | 组装策略 组装结果评估 |
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| 注释 | 重复序列注释 基因结构注释 基因功能注释 非编码RNA注释 |
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| 生物学分析 | 比较基因组学分析 | 基因家族分析 系统进化分析 正选择分析 共线性分析 |
| 个性化分析 | 针对物种自身特点 制定分析方案 |
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| 有参考基因组de novo 测序 | 特有基因检测 | |
| 变异检测 | ||
从基因组组装软件SOAPdenovo、SOAPdenovoⅡ到NOVOheter，从比对软件SOAP、SOAP2到SOAP3，从二代组装、二加三混合拼接到全三代组装，针对不同的基因组特征，采取不同的策略，致力于得到最优的组装结果。因为专注，所以专业，诺禾致源始终引领着基因组学的发展。
基因组De novo 测序采用先进的Illumina测序平台，快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台（High Performance Computing，HPC）采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合，实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展，高性能计算平台将会持续更新并扩容，以保证高效的数据处理和安全的数据存储。
诺禾致源的基因组合作项目遍布全球各地，引领基因组研究潮流。
截至2017年12月，发表高水平基因组文章8篇，其中2篇为封面文章。研究涉及鸟类、哺乳动物、水产生物、珍稀动物、昆虫、栽培作物、水果植物、药用植物、藻类、林木类、灌木类等诸多物种。
“科学的方案设计，严格的质控管理，专业的分析团队，丰富的项目经验，优质的项目服务”，
确保每一个环节都能出色完成，助力科学研究。
