高效捕获,深度测序,精确HLA分型
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服务商: 北京诺禾致源科技股份有限公司 | 查看该公司所有服务 >> |
人类白细胞抗原(HLA)位于6号染色体短臂上的一段约3.6M的参与免疫反应的多态性区域,
是基因中等位基因多态性最高的基因复合体,其多态性与多种疾病的遗传易感性有明显关系。
HLA捕获测序分型是专为研究HLA相关疾病的科研工作者提供的解决方案。
从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。
1.覆盖全面,涵盖整个HLA区域以及侧翼共将近5M的区间
2.罗氏Nimblegen试剂盒专为HLA打造的高效率捕获探针
3.高深度覆盖,数据更精确,提高对稀有变异的敏感性
4.高精度分型,满足研究自主免疫性疾病以及药物基因组等的科研需求
分析内容=标准分析+高级分析
基本信息分析 | 高级信息分析 |
1.数据质控:去除接头污染和低质量数据 2.与参考数据库 IMGT/HLA 进行比对,统计测序深度 3.从头组装HLA 基因 4.HLA型别分析,注释 |
1. 新的HLA型别鉴定 2. 基于统计学检验的显著性分析(case-control样本) |
采用先进的Illumina测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,以保证高效的数据处理和安全的数据存储。
诺禾致源疾病基因组事业部致力于精准医学的科研服务。结合专业的项目方案指导和分析流程,保证项目准确并且快速地进行。