CIRCRNA芯片服务

 þSinomics 非编码RNA芯片
近年来大量研究表明非编码RNA在人类疾病调控中扮演重要角色。为开发疾病诊断标志物和筛选新药靶标带来新方向。同时，越来越多的新的转录组实验结果表明，基因组非编码序列有绝大部分是可以表达的。越来越多的事实证明转录出来的非编码RNA具有重要的生物学功能。
相关系列芯片服务：
Sinomics lncRNA芯片、Sinomics circRNA芯片、Sinomics ceRNA芯片
Sino Human circRNA array V3.0
Sino Human circRNA array V3.0 是一款专门用来对circular RNA(circRNA)进行检测的高通量芯片。该芯片基于国际公认circRNA权威数据库circBase收录数据为基础，以Agilent eArray平台设计的芯片。
Sino Human circRNA array V3.0芯片特点
             设计平台：基于Agilent eArray平台设计，采用Agilent SurePrint喷墨打印技术合成，稳定性好；
 

• 探针特点：经典 60 mer探针长度，检出率高，重复性好；
• 检测特点：针对特异性剪接位点为中心的探针设计，检测circRNA特异性好；
• 数据来源：以国际主流circRNA数据库CircBase为主，结合现有对circRNA疾病，功能研究数据库整合，来源范围广，参考意义大；
• 检测数据：通过对circBase来源数据的去冗余，探针预设计等，最终筛选到53,635条circRNA作为检测对象。

Sino Human circRNA array V3.0芯片数据分析
 

1.   原始数据处理分析
2.    差异基因筛选

3.  母基因功能分析（GO/KEGG）

 

1.   circRNA 吸附 miRNA 预测

近年的研究表明，circRNA分子富含microRNA结合位点，在细胞中起到miRNA海绵（miRNA sponge）的作用，进而解除miRNA对其靶基因的抑制作用，升高靶基因的表达水平，这种机制称为竞争性内源RNA（ceRNA）机制。我们通过对circRNA与miRNA可能结合的位点分析，预测circRNA吸附的miRNA分子，以便于从ceRNA角度研究circRNA的分子功能。
5.  circRNA 疾病与外泌体研究注释
  外泌体形成是由细胞膜内陷，形成内体(endosome)，再形成多泡体(multivesicular bodies，MVB)，最后分泌到胞外的囊泡结构。外泌体携带有母细胞的多种蛋白质、脂类、DNA和RNA（mRNA, lncRNAs, miRNAs, circRNA）等重要信息。我们采用exorbase （http://www.exorbase.org/）数据库，对已有研究的外泌体中发现的circRNA进行注释，为后续研究，特别是外泌体研究提供参考。
 

深圳中科普瑞基因科技有限公司，由基因科技领域的老兵组成的新军。企业创始人与核心骨干团队均从事该行业15年以上，目前着力布局基因检测的临床应用开发与科研技术服务平台。

中科普瑞下设全资子公司上海鲸舟基因科技有限公司/上海鲸舟医学检验所；立足新一代测序及其衍生技术，以医学生物信息学为核心，以各联合创始人在生物技术领域十余年工作和技术积累为资源依托，提供覆盖肿瘤等重大疾病风险评估，早期筛查，分子病理诊断，用药指导和预后预测，甲基化研究和应用、新型病原微生物感染和耐药的基因组检测等符合临床需求的解决方案，同时通过资本的纽带连接，打通上下游产业链，为精准医疗打造全方位医学诊断和服务平台，公司的中长期发展策略为医学大数据挖掘和人工智能的临床辅助诊断应用，公司的愿景是为每一个病患打造精准医疗路线图，为每一个健康人描绘基因风险预测全景，携带你的基因去远行！

公司以深圳及上海两地实验室为依托，目前已诚意推出两大品牌产品：分别为面向大众健康服务的“轻基因LightGenes”及针对临床诊疗服务的“普瑞昂科PrecisionOnco”，向国内外生物医学领域提供肿瘤等疾病用药指导及预后预测基因检测、重大疾病遗传风险评估、及符合临床需求的解决方案。