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宏转录组测序
宏转录组(Metatranscriptome)测序是以特定样品中微生物群落的全部RNA为研究对象,从转录水平上分析微生物群落中活跃菌种的组成以及活性基因的表达情况。
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最后更新:2021-8-19半年访问:26
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  • 服务介绍
  • 公司简介
宏转录组(Metatranscriptome)测序是以特定样品中微生物群落的全部RNA为研究对象,从转录水平上分析微生物群落中活跃菌种的组成以及活性基因的表达情况。宏转录组在进行物种鉴定的同时,也能研究活跃菌种以及高表达基因的组成情况,揭示特定环境因子影响下菌种的适应性以及基因表达可能的调控机制。此外,宏转录组测序研究避开了微生物分离培养的过程,扩展了微生物资源的利用空间,为微生物的转录研究提供了有效工具。
 
技术优势
  • 适用范围广:宏转录组测序无需对微生物进行分离培养,就可以对样品中的微生物群落进行全面的检测,扩展了微生物研究范围
  • 检测信息全面:直接对环境中所有的微生物转录组进行检测,比微生物个体研究更能反映微生物生存的真实状态
  • 灵敏度高:高通量覆盖,不仅能检测样品中高丰度的微生物,还能发现痕量微生物物种信息
  • 准确度高:直接读取微生物转录组序列,准确性高
 
数据分析
基本分析 高级分析
1.  原始数据整理,过滤和质量评估 根据客户的具体研究进行的个性化定制
2.  与参考宏基因组比对  
3.  不同类群表达基因组成分析  
4.  转录组表达量计算  
5.  差异表达分析  
6.  差异表达基因的GO和信号通路分析  
 
数据展示
上图:mRNA转录本的细菌分类分析

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1. 测序服务
转录组 表观遗传组 基因组
真核生物 原核生物
miRNA测序 细菌sRNA测序 MeDIP测序 目标序列靶向测序
小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA) 原核生物mRNA测序 RRBS测序 外显子组测序
lncRNA测序 宏转录组测序 全基因组甲基化测序 人类基因组重测序
环状RNA测序 原核生物转录组测序 ChIP测序 16S rDNA测序
mRNA测序 原核De novo转录组测序   宏基因组测序
RIP测序      
降解组测序      
转录组测序      
De novo转录组测序      
 
2. 生信服务 & PCR技术服务
生信服务 实时定量PCR服务
转录组 表观遗传组 基因组 联合分析
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lncRNA分析 ChIP测序分析 微生物菌落分析 LncRNA-mRNA 环状RNA实时定量PCR
mRNA分析   宏基因组分析 LncRNA-miRNA-mRNA LncRNA实时定量PCR
microRNA分析       miRNA实时定量PCR
细菌sRNA分析       mRNA实时定量PCR
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