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高通量测序服务-长链非编码RNA(lncRNA)
lncRNA是一类长度大于200nt且无或少有蛋白编码能力的复杂RNA,广泛存在于各种生物体内。在表观遗传学、转录及转录后等多种水平调控基因表达,在疾病的病理生理过程中起着重要的调节作用。
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最后更新:2016-10-18半年访问:24
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服务商: 南京世和基因生物技术有限公司 查看该公司所有服务 >>
  • 服务介绍
  • 公司简介

世和基因--高通量测序服务专家

        

   2016年,世和基因引进HiSeq X “超级” 测序平台,致力于成为全球领先的基因组学研究解决方案提供者,专注于动植物生命科学,临床转化医学,人类健康,及药物研发等领域的开发应用。现在公司高通量测序平台包括 10 台 HiSeq X、HiSeq 4000、MiSeq、NextSeq 500等平台,可满足临床诊疗业务及科研业务不同需求,是基因组学的首选合作伙伴。HiSeq X Ten是Illumina公司推出的最高通量,最高效率,最低成本的测序系统,首次实现了将人类基因组重测序成本降低到了1000美金以下。HiSeq X Ten由10台超高通量测序仪HiSeq X组成,系统单台仪器每次运行可产出高达1.8Tb的数据,测序读长为2×150b,运行时间为三天以内。10台仪器同时运行时,每年可完成可超过18000个人类基因组重测序(30×覆盖度)。因此,HiSeq X Ten系统将使研究人员更易于开展大规模人类基因组测序,并将有利于深入挖掘与癌症及复杂疾病相关的遗传变异。

   长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200nt且无或少有蛋白编码能力的复杂RNA,广泛存在于各种生物体内。以RNA形式在表观遗传学、转录及转录后等多种水平调控基因表达,在疾病的病理生理过程中起着重要的调节作用。lncRNA测序服务,一次性获得样本中几乎全部的mRNA和lncRNA信息,全面深入地研究lncRNA的功能提供了全新的工具。

 

服务相关-样品要求:

样品类型

总 RNA 样本

样品量

≥ 5ug

样品质量

RNA无明显降解,提取的总RNA,OD260/280值在1.8~2.2之间,浓度≥500 ng/μL,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 7。

样品保存

RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。

样品运输

置于1.5 mL管中,封口膜封好,干冰运输。

 

生物信息学分析内容:

  1. 数据质量评估与过滤
  2. mapping至参考基因组
  3. 已知mRNA鉴定
  4. mRNA表达谱分析 (包括SNP、indels分析)
  5. 已知lncRNA鉴定
  6. lncRNA表达谱分析
  7. 预测新lncRNA
  8. 样品间lncRNA差异分析
  9. 差异基因的GO分类和KEGG富集分析

 

公司简介:

    世和基因是癌症个体化医疗诊断及高通量测序行业的先行者与领航者,2008年末一批在生物医药领域有突出贡献的北美华人科学家开始致力于高通量全景癌症基因测序的研究。世和基因生物技术团队由多名多伦多大学,哈佛大学,斯坦福大学,新加坡国立大学,北京大学及NIH博士和专家组成,专注于高通量测序、癌症生物学、生物信息学领域并拥有丰富的分子遗传研究及临床转化经验。 世和基因依托雄厚的技术实力与世界顶级综合性医院、大学、研究所携手生命科学领域研究,共同推进基础研究向临床成果转化。同时,世和基因科研团队在科研立项、投稿、沟通、修改上处于国际领先水平,至今已发表高影响因子文献(20分以上)近10篇,并拥有数项核心专利。

 

世和优势: 

1. 严格的质量把控

世和基因的测序流程在符合国际标准的临床实验室开展,执行最严格的质量监控,完善的实验流程管理,智能化LIMS报告系统。

2. 高稳定的数据输出

使用illumina原厂进口测序试剂,配备了高通量测序所需的全套分子生物学设备。世和基因在碱基准确度、测序均一性、可用数据比例等方面的质量标准均全球遥遥领先。我们不仅承诺lane/flow cell/run 的总数据量,还承诺测序数据的Q30。

 3. 多样化的测序平台

世和基因拥有HiSeq X, HiSeq 4000, MiSeq, NextSeq 500等测序仪,多种测序平台保证了项目的快速进行及灵活性。

4. 强大的技术支持与生物信息分析团队

丰富的基因组项目及处理不同样品的经验,技术支持由国际名校的博士团队承担,强大的生物信息团队可针对不同项目进行深入分析与数据挖掘,保证提供最优最新最全的解决方案。

5. 价格优势及短周期

世和基因致力于不断降低顾客的测序成本,缩短测序周期。我们承诺提供优于同行的测序价格和测序周期。

 

世和基因中国总部

南京世和基因生物技术有限公司

南京高新技术产业开发区新锦湖路3号-1

中丹生态生命科学产业园02栋18楼

邮编:210061

电话: 400-636-2325

信息咨询: info@geneseeq.com

业务咨询: tony.wang@geneseeq.com

合作咨询: partnership@geneseeq.com

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