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RNA测序技术服务
相对于传统的芯片杂交平台,RNA测序无需预先针对已知序列设计探针,即可在转录本水平和基因水平对整体转录活动进行检测。
服务类别:测序/合成总访问:1268
最后更新:2018-11-26半年访问:2
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RNA测序技术服务

      相对于传统的芯片杂交平台,RNA测序无需预先针对已知序列设计探针,即可在转录本水平和基因水平对整体转录活动进行检测。并且具有定量更准确,检测通量更高,检测范围更广等优点。此外,在分析转录本的结构和表达水平的同时,还能发现未知转录本和稀有转录本,精确地识别可变剪切位点以及可能的点突变,提供最全面的转录组信息。
 

康成生物基于Illumina高通量测序平台,为您提供一站式RNA测序技术服务,您只需要提供保存完好的组织或细胞标本,康成的技术服务人员就可为您完成全部实验操作,包括RNA抽提、rRNA去除、文库构建、高通量测序和数据分析、并提供完整的实验报告。


RNA-seq技术优势

  • 数字化信号:直接测定每个转录本片段序列,单核苷酸分辨率的精确度,同时不存在传统微阵列杂交的荧光模拟信号带来的交叉反应和背景噪音问题。
  • 高灵敏度:能够检测到细胞中少至几个拷贝的稀有转录本。
  • 任意物种的全基因组表达分析:无需预先设计特异性探针,因此无需了解物种基因信息,能够直接对任何物种进行转录组分析。同时能够检测未知基因,发现新的转录本,并精确地识别可变剪切位点及cSNP,UTR区域。
  • 更广的检测范围:高于6个数量级的动态检测范围,能够同时鉴定和定量稀有转录本和正常转录本。
     

康成生物RNA-seq技术服务特色

1. 采用rRNA去除方法富集,检测更为全面

采用去rRNA的方法进行RNA富集,同时保留带PolyA尾和不带PolyA尾的RNA,为您的研究提供全面可靠的数据。

 

*图释:康成生物的RNA富集方案能够有效的保留带PolyA尾巴和不带PolyA尾巴的转录本,从而为客户提供更加全面可靠的数据。

 

2. 可采用降解的RNA进行实验,特别适用于临床样品(如FFPE样品)的检测

康成生物采用的去rRNA试剂盒能够有效的去除降解的rRNA,对功能性的RNA分子进行有效的富集, 特别适用于临床样品的检测。

*图释:康成生物的RNA富集方案适用于降解的RNA样品。

 

3. 链特异性文库构建

采用的链特异性文库构建方法,可以有效区分正义链和反义链,帮助您同时获得准确的正义链和反义链RNA的表达信息。

 

 

 

 

 

 

 

 

 


 

*图释:康成生物采用链特异性的建库方法,可以有效区分正义转录本和反义转录本。

 

4.均匀覆盖转录本,5’3’端偏好性低

采用基于dUTP的建库方案,Reads均匀覆盖转录本,测序结果更可靠。

 

*图释:康成生物采用基于dUTP的建库方法,测序结果无5’和3’偏好性。


康成生物RNA-seq数据结果展示

1. 基因集富集分析 (GSEA):利用一列(排序的)基因进行基因集富集分析,能够揭示这些基因在不同基因集间的富集情况。

 

*图释:基因集富集分析显示在Cell Cycle Pathway基因集中富集

 

2. 网络分析:通过GO富集分析挑选感兴趣的GO term,对其中的基因构建基因网络图。

*图释:GO term-基因网络图,绿色和蓝色:特异基因;红色:共有基因

 

3. RNA-SeqChIP-Seq整合分析:通过整合RNA-Seq结果和ChIP-Seq富集峰,能够更直观地了解基因启动子区的特征。

*图释:启动子区的RNA-Seq和ChIP-Seq可视化信号

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