长链非编码RNA(LncRNA)测序服务

技术简介 

长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）是一类长度大于200nt且无或少有蛋白编码能力的复杂RNA，广泛存在于各种生物体内。以RNA形式在表观遗传学、转录及转录后等多种水平调控基因表达，在疾病的病理生理过程中起着重要的调节作用。lncRNA测序服务，一次性获得样本中几乎全部的mRNA和lncRNA信息，为您全面、深入地研究lncRNA的功能提供了全新的工具。

技术优势
 通过第二代高通量测序技术，可获得样本中几乎全部的lncRNA序列信息，不局限于对已知lncRNA的研究，还可对未知的lncRNA进行预测；
 通过优化文库构建流程，使插入片段更长，更利于lncRNA的分析；同时减低了对RNA起始量与质量要求；
 数据分析不限于lncRNA，也可对环形RNA等非编码RNA进行分析；
 个性化跟踪分析，让数据分析更有针对性，更加顺畅。
 

技术路线图
 

生物信息学分析

 
无参考序列的长链非编码RNA（LncRNA）测序信息分析
常规分析：
  1.测序数据质控分析
  2.转录组的拼接和组装
  3.mRNA预测及表达谱分析
  4.lncRNA预测及表达谱分析
  5.lncRNA功能预测

高级分析：
  6.样本间mRNA差异表达分析
  7.样本间lncRNA差异表达分析
  8.差异基因的GO分类和KEGG富集分析
  9.lnRNA与mRNA关联分析及共表达网络构建

个性化分析：
 10.根据客户需求进行个性化定制分析。

有参考序列的长链非编码RNA（LncRNA）测序信息分析
常规分析：
  1.测序数据质控分析
  2.高质量序列与参考基因组比对
  3.已知mRNA鉴定
  4.mRNA表达谱分析
  5.已知lncRNA鉴定
  6.lncRNA表达谱分析
  7.预测新lncRNA
  8.新lncRNA的功能预测
  9.新lncRNA二级结构预测及表达谱分析

高级分析：
 10.样本间mRNA差异表达分析
 11.样本间lncRNA差异表达分析
 12.差异基因的GO分类和KEGG富集分析
 13.时间序列的差异表达分析
 14.lnRNA与mRNA关联分析及共表达网络构建

个性化分析：
 15.根据客户需求进行个性化定制分析
 

案例解析  

长链非编码RNA组成
    转录组测序分析揭示肺癌样本中长链非编码RNA（lncRNA）的转录本长度分布及所在外显子的数量分布信息。   （White, Nicole M., et al., 2014）

 长链非编码RNA差异表达分析

  小鼠红细胞组织特异性富集长链非编码RNA位点分析，揭示不同组织的表达差异水平。  

   

(Alvarez-Dominguez, Juan R., et al., 2014)

环形RNA的组成及分布

文氏图揭示人体不同细胞间，线虫不同发育时期的环形RNA数量差异及人类环形RNA的基因组起源。   

(Memczak, Sebastian, et al., 2013)

测序策略及数据量
    测序策略：PE125 / PE150 / PE250
    建议数据量：一般测序8~10Gb

北京阅微基因技术股份有限公司（证券简称：阅微基因，证券代码：873723.NQ）主要从事多基因联合检测产品的研发、生产和销售业务，并基于中等通量基因检测技术平台为下游客户提供技术服务及创新解决方案，产品及服务广泛应用于临床医学、法庭科学、工农业及其他领域。

阅微基因总部位于北京市海淀区中关村科技园区，在北京和苏州均设有GMP生产基地，并在全国设有多个子公司及技术服务中心，2018年阅微基因在哈萨克斯坦成立海外子公司，开始积极拓展海外业务。公司迄今已获数十项发明专利及软件著作权，多年来持续获得国家高新技术企业认证，并荣获2020年北京市专精特新“小巨人”企业称号、工业和信息化部第二批专精特新“小巨人”企业称号。

阅微基因以市场需求为导向，充分发挥在基因检测领域的技术积淀，以“中通量荧光PCR-毛细管电泳平台”为核心技术平台，形成检测设备、检测试剂及软件系统开发和服务等关键能力，致力于重大疾病谱的临床医学领域和法庭科学基因检测领域的技术进步和产品开发，逐渐成为国内基因检测领域具有设备、试剂、软件一体化优势的创新企业。