小RNA测序

技术简介

小RNA是一类重要的体内调节分子，主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是诱导基因沉默，参与基因转录后调控，从而调节细胞生长、分化，以及个体发育、生殖等重要生物学过程。采用高通量测序技术，一次性获得单碱基分辨率水平的数百万条小RNA序列信息，依托强大的生物信息学分析平台，鉴定已知小RNA，并预测新的小RNA及其靶标基因。

技术路线

生物信息学分析

 
常规分析：
1.测序数据质控分析
2.高质量序列与miRNA数据库比对
3.小RNA分类及注释：miRNA, siRNA, piRNA, rRNA, tRNA, snRNA, snoRNA, repeat asscociated sRNA等
4.预测新的miRNA
5.miRNA靶基因预测
6.靶基因功能注释、GO富集分析和代谢通路富集分析
7.miRNA表达谱分析

高级分析：
8.样本间miRNA表达差异分析
9.与mRNA进行关联分析（需要有mRNA数据）

个性化分析：
10.根据客户需求进行个性化定制分析。

案例解析

小RNA的差异表达分析

自组织热图分析揭示猪鞭虫的幼虫、成体及组织特异文库中小RNA的转录表达差异。

测序策略及数据量

测序策略：PE36或PE50

建议数据量：一般测序：10M reads 或15M reads

深度测序：20M reads

北京阅微基因技术股份有限公司（证券简称：阅微基因，证券代码：873723.NQ）主要从事多基因联合检测产品的研发、生产和销售业务，并基于中等通量基因检测技术平台为下游客户提供技术服务及创新解决方案，产品及服务广泛应用于临床医学、法庭科学、工农业及其他领域。

阅微基因总部位于北京市海淀区中关村科技园区，在北京和苏州均设有GMP生产基地，并在全国设有多个子公司及技术服务中心，2018年阅微基因在哈萨克斯坦成立海外子公司，开始积极拓展海外业务。公司迄今已获数十项发明专利及软件著作权，多年来持续获得国家高新技术企业认证，并荣获2020年北京市专精特新“小巨人”企业称号、工业和信息化部第二批专精特新“小巨人”企业称号。

阅微基因以市场需求为导向，充分发挥在基因检测领域的技术积淀，以“中通量荧光PCR-毛细管电泳平台”为核心技术平台，形成检测设备、检测试剂及软件系统开发和服务等关键能力，致力于重大疾病谱的临床医学领域和法庭科学基因检测领域的技术进步和产品开发，逐渐成为国内基因检测领域具有设备、试剂、软件一体化优势的创新企业。