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复杂基因组测序

复杂基因组测序


Complex genome sequencing
复杂基因组主要包括以下几类:杂合基因组,高重复基因组,多倍体基因组.
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最后更新:2015-8-4半年访问:9
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复杂基因组测序
复杂基因组主要包括以下几类:杂合基因组,主要指杂合率高于0.8%的二倍体基因组,如大部分水产类和昆虫等;高重复基因组,主要指重复序列比例高于50%的二倍体基因组,如大部分林木等;超大基因组,基因组大小大于3G,甚至是10G以上的物种,如两栖类和部分林木;多倍体基因组,如四倍体、六倍体植物等。

 

基因组组装的难易程度是由基因组本身的结构决定的,主要包括基因组重复序列的长度及数量、基因组杂合程度、基因组大小、基因组GC含量等因素。目前主流的测序手段还不能很好的处理复杂基因组的测序,而采用第一代、第二代与第三代测序技术相结合的策略,可以很好的解决这一问题。

 

技术优势
        最高的N50组装指标
        最少的contig数量
        极大提高复杂基因组的组装质量
        可以获得超高精度的基因组图谱

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