复杂基因组测序
复杂基因组主要包括以下几类:杂合基因组,主要指杂合率高于0.8%的二倍体基因组,如大部分水产类和昆虫等;高重复基因组,主要指重复序列比例高于50%的二倍体基因组,如大部分林木等;超大基因组,基因组大小大于3G,甚至是10G以上的物种,如两栖类和部分林木;多倍体基因组,如四倍体、六倍体植物等。
基因组组装的难易程度是由基因组本身的结构决定的,主要包括基因组重复序列的长度及数量、基因组杂合程度、基因组大小、基因组GC含量等因素。目前主流的测序手段还不能很好的处理复杂基因组的测序,而采用第一代、第二代与第三代测序技术相结合的策略,可以很好的解决这一问题。
技术优势
最高的N50组装指标
最少的contig数量
极大提高复杂基因组的组装质量
可以获得超高精度的基因组图谱
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武汉菲沙基因信息有限公司位于武汉国家生物产业基地——光谷生物城,是一家集三维基因组学技术服务、第二代和第三代基因测序、生物信息软件开发、生物信息分析、基因组数据库搭建、分子标记开发、基因检测技术研发等生物信息上下游产业于一体的高新技术企业。菲沙基因联合国内外著名高校和科研机构,拥有一批国际知名的基因组学和生物信息学专家,致力于提供全球领先的生物信息技术服务。
依托国际先进的第二代和第三代高通量测序平台,以及20万亿次的高性能计算平台,菲沙基因可以针对人类健康、疾病防治、环境保护、动植物研究、微生物应用等不同领域的基因组学问题展开研究,能够为不同需求的合作伙伴提供包括实验设计、样品选取、测序策略,以及后续定制化信息分析在内的一站式、个性化整体解决方案。
随着科学技术的发展,即将到来的基因组学第三次浪潮——三维基因组研究,已经成为全球生物学界的科研焦点。菲沙基因在提供3C、4C、5C、Hi-C等三维基因组构象技术服务的基础上,在国内率先引进最新的染色质远程交互测序技术(ChIA-PET),为进一步研究基因组三维空间结构与功能提供了完整解决方案,能够协助合作伙伴在下一轮基因组研究浪潮中抢占学科发展的有利先机。
凭借全球领先的生物信息分析能力,菲沙基因已经以多种形式先后与国内外著名高校和科研机构展开了深度合作,合作伙伴包括杰克森实验室、西蒙菲沙大学、中国科学院、中国农科院、清华大学、上海交通大学、复旦大学、华中农业大学、第二军医大学、同济医院、上海东方肝胆外科医院等。
“以生物信息学助推生命科学的研究,以基因组医学促进人类健康的发展”是菲沙基因的使命;“成为生物信息学领域的引领者”是菲沙基因的愿景。我们期望与各领域的专家合作,制定最优的解决方案,提供快速、准确、专业的服务,共同迎接生命科学研究中的挑战。